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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Abinit » vasp跑分子动力学的时间
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yuanxliang

银虫 (小有名气)

[交流] vasp跑分子动力学的时间

vasp跑分子动力学一般要多久啊，我NSW设置的2000，POTIM设置的3，一个120原子的二维材料跑了快20天了还没跑完，后来将NCORE改为8和12试了一下，还是很慢。
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1楼2024-03-25 20:24:48
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清风拂清

新虫 (初入文坛)
★
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
你这个确实太慢了，检查一下内存

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2楼2024-03-25 20:26:49
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yuanxliang

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 清风拂清 at 2024-03-25 20:26:49
你这个确实太慢了，检查一下内存

如果内存不够了咋办呢，新手不太懂内存这个东西，显示Available: 85.06G，不知道够不够，求大佬指教
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3楼2024-03-25 20:39:58
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专注做科研的

新虫 (初入文坛)
★
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
VASP对内存要求比较高，一般要配置满通道，比如现在用的2颗志强的CPU，一个CPU要配8根内存，2个要配16根内存，具体看下你的服务器配置是否合理以及例子是否需要调整
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10楼2024-03-29 10:13:16
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yuanxliang

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 专注做科研的 at 2024-03-29 10:13:16
VASP对内存要求比较高，一般要配置满通道，比如现在用的2颗志强的CPU，一个CPU要配8根内存，2个要配16根内存，具体看下你的服务器配置是否合理以及例子是否需要调整

我是在超算上算的，配置应该不会低吧？
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12楼2024-03-29 15:19:38
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专注做科研的

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by yuanxliang at 2024-03-29 15:19:38
我是在超算上算的，配置应该不会低吧？...

你可以问下超算具体的配置是什么样子的，什么CPU、内存等，排除硬件问题，如果硬件配置合理的话，是不是例子需要调整，我们之前有位老师用VASP，就是256核算的都很慢，最后发现是例子问题，调整过后，计算速度飙升
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14楼2024-04-01 09:16:37
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gan129147

新虫 (小有名气)
★
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
你是用几个核心跑的，虽然只跑了2000步，但是每一步收敛没有，NELE一般默认60，你用的是gamma点吗，有很多很多参数可以调解加快计算，一般我算这个几小时就跑完了，如果是20000步，加上machine learning也是几小时

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16楼2024-04-07 13:37:12
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yuanxliang

银虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by gan129147 at 2024-04-07 13:37:12
你是用几个核心跑的，虽然只跑了2000步，但是每一步收敛没有，NELE一般默认60，你用的是gamma点吗，有很多很多参数可以调解加快计算，一般我算这个几小时就跑完了，如果是20000步，加上machine learning也是几小时
...

一个节点24个核，用的是gamma点，这是我的INCAR，求指教。
#Startparameter for this run
  PREC = Low
  ISTART = 0         
#  ICHARG = 2         
  ENCUT= 520

#Electronic relaxation
  NELM = 150         
  NELMIN = 4         
  NELMDL = -12        
  EDIFF = 1.E-05   
  ALGO  = Very Fast
  ISYM = 0

#Ionic relaxation
  EDIFFG = -0.02   
  NSW = 2000         
  IBRION = 0         
  ISIF = 2            
  POTIM = 3   
  GGA = PE
#AIMD
  MDALGO = 1
  ANDERSEN_PROB = 0.5
  TEBEG = 600
  TEEND = 600
#DOS related values
  ISMEAR = 0         
  SIGMA = 0.1

#Write flags
  LWAVE = F            
  LCHARG = F            
#LORBIT = 12
# LVHAR=T
  NCORE=12
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17楼2024-04-08 16:26:01
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wwjdwwjd4楼
2024-03-25 21:58   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
xiaoqiuqiu205楼
2024-03-25 22:00   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
tzynew6楼
2024-03-25 22:44   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
toppaper7楼
2024-03-25 23:09   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
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hyjcs8楼
2024-03-25 23:17   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
噢 发自小木虫Android客户端
miaojiabing9楼
2024-03-28 20:55   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
假大空11楼
2024-03-29 11:18   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
·
jiaoxg13楼
2024-03-29 17:18   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
XG-WUST15楼
2024-04-06 21:29   回复  
yuanxliang(金币+1): 谢谢参与
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