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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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caozf

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】激发态请教

各位高手,小弟请教一个问题:
      我现在要预测卟啉在真空中的紫外吸收光谱以及卟啉和NO2作用后紫外吸收光谱。
      卟啉的紫外光谱已经预测出,具体做法是用DMOL来优化它的结构,用VAMP来算它的激发态。
      但是在预测后面一个得时候遇到了问题:我首先分别优化了卟啉和NO2的分子,然后将两者放在一起,这里我遇到了问题,我是要将两者放在合适的位置让他成键呢,还是要用BULID里的bond让它们自动成键呢?我发现放在合适的位置后他们最后不能成键,(我是放在了合适的位置),两者我都做过了。然后用VAMP优化激发态我发现最后的振动强度全是零。不知道为什么?请大家帮忙。谢谢!
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shenxianshifu

至尊木虫 (知名作家)

宗师

正在学习中,帮你顶起来
2楼2009-10-19 21:06:05
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liazhi2008

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
caozf(金币+2,VIP+0): 10-20 08:33
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论! 10-20 20:46
试一下把优化好的卟啉和NO2放在一起(选择合适位置),先优化,将优化结果再进行计算,应该行!
3楼2009-10-20 07:48:44
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liusanbing

铜虫 (正式写手)

★ ★ ★
caozf(金币+2,VIP+0): 10-20 08:33
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论! 10-20 20:47
把优化好的卟啉和NO2放在一起(选择合适位置),两者靠近,几乎开始成键,考虑尽量多的位置,几何优化后再用VAMP来算它的激发态。
4楼2009-10-20 08:11:51
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caozf

金虫 (小有名气)

放在合适的位置,优化后会自动成键吗?很奇怪的是我算出来的振动强度为0.
5楼2009-10-20 08:39:45
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liusanbing

铜虫 (正式写手)


zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论! 10-20 20:47
放在合适的位置优化后会自动成键,你可以试试,建立初始构型时就让它成键,不过也不要靠的太近,比方说卟啉上有氧,可以让NO2的N端靠近,初始时NO2的N与卟啉上的氧几乎成键
6楼2009-10-20 10:00:43
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caozf

金虫 (小有名气)

我首先使用build里面的bond 让他成键 然后把键删了,这样可以吗。还是怎样?
7楼2009-10-20 10:25:21
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