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gdongli8325

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 片段反向链接到载体??

最近做TOPO 克隆,测序前的检测是片段正向连接到了载体,但是测序后分析却是片段反向连接的,不知道什么原因啊?恳请高人赐教。此外,测序结果有的序列不好,那这个序列还能用于后续分析吗?如果经过BLAST,能找到相似的序列,这个结果可靠吗?
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695

木虫 (职业作家)


gdongli8325(金币+2):谢谢参与
进行不进行后续要看你的实验目的了吧,我也是RACE得到的序列,最近也在做载体去磷酸化连接之类的
2楼2009-10-16 03:38:30
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小瞥

铁虫 (小有名气)


gdongli8325(金币+2):谢谢参与
测序是最准确的,如果序列不好,最好不要,但LBAST,结果应该可以的
3楼2009-10-16 08:23:23
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bioxixi

木虫 (著名写手)


gdongli8325(金币+2):谢谢参与
应该以测序结果为准
有不准确的地方,就再测一次,或换更好的生物公司测
4楼2009-10-16 08:25:50
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xiangao

金虫 (正式写手)


gdongli8325(金币+2):谢谢参与
有可能挑的菌不纯,出现正反向都有的情况。建议再转接一次构建的菌,挑单菌落验证
5楼2009-10-16 11:45:14
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)


gdongli8325(金币+2):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by gdongli8325 at 2009-10-16 01:52:
最近做TOPO 克隆,测序前的检测是片段正向连接到了载体,但是测序后分析却是片段反向连接的,不知道什么原因啊?恳请高人赐教。此外,测序结果有的序列不好,那这个序列还能用于后续分析吗?如果经过BLAST,能找到 ...

"测序前的检测是片段正向连接到了载体"你是怎样检测的呢?
6楼2009-10-18 20:43:01
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