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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】按这个要求怎么优化？
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405963512

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】按这个要求怎么优化？

这是我看的一篇文献的一部分，按照他的要求，在vasp4.6中，应该怎么设置，求大家帮忙指出。
keeping the two transversal dimensions fixed, in order
to maintain the lateral separation between adjacent replicas. For
this optimization, we did total-energy and force calculations at a
number of selected lattice parameters by relaxing all the atomic
coordinates until the forces on all atoms were smaller than 300
meV/Å for each selected lattice constant. The optimal a0 values
(Table 1) derive from the quadratic fitting of the total energy profile
as a function of the lattice parameter and estimation of the total
energy minimum
文中提到，要固定两个轴的长度，优化第三边，这个该怎么操作啊？谢谢。是正交晶系。
我刚学不久，希望大家多说几句，给我这个初学者讲的清楚些。
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1楼 2009-10-15 15:34:13
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★ ★
405963512(金币+1,VIP+0): 10-15 21:01
aylayl08(金币+1,VIP+0):感谢您的解答讨论 10-15 22:08
对于 vasp来说，无法自动固定一个边优化另外两个边，这也就是为什么很少有人用vasp做单向加载的原因
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2楼2009-10-15 19:45:40
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405963512

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wuchenwf at 2009-10-15 19:45:
对于 vasp来说，无法自动固定一个边优化另外两个边，这也就是为什么很少有人用vasp做单向加载的原因

是固定两个边，优化第三个边，那我想知道是否可以理解为固定这两个轴上的原子坐标呢？在POSCAR用select选项？
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3楼2009-10-15 21:02:17
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zdd2008

金虫 (职业作家)
★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):感谢您的解答讨论 10-16 08:42
405963512(金币+1,VIP+0): 10-16 10:19
引用回帖:
Originally posted by wuchenwf at 2009-10-15 19:45:
对于 vasp来说，无法自动固定一个边优化另外两个边，这也就是为什么很少有人用vasp做单向加载的原因

同意！但是固定两个边，而优化一个边应该是可以的！！！楼主的问题应该可以解决的！！呵呵！
楼主说的原子位置我认为不要固定！因为做这样的结构优化！还是弛豫原子位置的好，把晶格中的内应力释放出来！呵呵！

[ Last edited by zdd2008 on 2009-10-15 at 23:01 ]
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4楼2009-10-15 22:58:26
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★
aylayl08(金币+2,VIP+0):感谢耐心解答 10-16 08:49
405963512(金币+1,VIP+0): 10-16 10:18
引用回帖:
Originally posted by 405963512 at 2009-10-15 21:02:

是固定两个边，优化第三个边，那我想知道是否可以理解为固定这两个轴上的原子坐标呢？在POSCAR用select选项？

哦，sorry看错了，不过原理是类似的。就是在vasp的控制文件中的参数只能将三边分别视为一个独立的自由度，这点好像是不同于AB-INITK可以独立优化某个边。但是我说的是无法由软件自动优化，但是手动是可以优化的，和晶格常数的拟合是一个道理的。固定两个边，优化第三个边，其实就是我们在计算材料的弹性常数的时候用的方法。
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5楼2009-10-16 08:39:45
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论！ 10-20 20:53
引用回帖:
Originally posted by zdd2008 at 2009-10-15 22:58:



同意！但是固定两个边，而优化一个边应该是可以的！！！楼主的问题应该可以解决的！！呵呵！
楼主说的原子位置我认为不要固定！因为做这样的结构优化！还是弛豫原子位置的好，把晶格中的内应力释放出来！呵 ...

同意，其实我们算弹性常数就是这么搞的，
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6楼2009-10-16 08:43:38
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405963512

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wuchenwf at 2009-10-16 08:39:



哦，sorry看错了，不过原理是类似的。就是在vasp的控制文件中的参数只能将三边分别视为一个独立的自由度，这点好像是不同于AB-INITK可以独立优化某个边。但是我说的是无法由软件自动优化，但是手动是可以优 ...

谢了先，我请问一下，你说的这个怎么操作呢，能否简单说一下？测试晶格常数那个我会，但是如何固定另两边呢？
我正常优化了之后，三个边长都改变，怎么弄啊，请教le !
1
14.2659235355597396    0.0012224547097554    0.0004696897821794
     0.0006928755657755    8.4559734486308127   -0.0003376403996996
     0.0004694438248019   -0.0006153047683051   14.2671845079608985
这是优化后的常数，我设置时是
1
15 0 0
0 8.5 0
0 0 15
想优化b轴，a，c不变，希望大家给个建议
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7楼2009-10-16 10:25:20
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stractor

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
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aylayl08(金币+2,VIP+0):感谢交流 10-16 18:44
引用回帖:
Originally posted by wuchenwf at 2009-10-15 19:45:
对于 vasp来说，无法自动固定一个边优化另外两个边，这也就是为什么很少有人用vasp做单向加载的原因

对,也就是很少友人用VASP计算应力应变关系的原因.德国的张用VASP计算了应力应变曲线,估计他改VASP的源代码.计算应力应变曲线他就是优化与施加应变方向正交的两个基矢,而固定加应变的基矢.我认为需要改变VASP的代码.

[ Last edited by stractor on 2009-10-16 at 11:33 ]
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8楼2009-10-16 11:29:47
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这个我在你发的另一个帖子里说的很详细了啊。。
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9楼2009-10-16 21:07:52
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q!~ 鼓励讨论！ 10-20 20:54
改一下源代码就可以了。 不是很难！
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真理是一点点接近的！
10楼2009-10-19 21:16:00
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