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bbslover金虫 (正式写手)
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[交流]
【讨论】有关描述子压缩问题？
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都知道2d-qsar首先会计算大量的描述子，然后对其进行压缩，选择最重要的几个，那压缩过程中是对那个集合呢？ 1.对训练集？ 然后用选出来的描述子建立模型，看看模型的r和q？ 如果还可以的话再用这个模型来预测测试集？ 2.对整个集合？压缩完再分训练集和测试集？再训练模型，验证模型？但是这样的话测试集参与了变量压缩？不应该这样做吧？ 3.衍生出第三个问题。是先对集合划分训练集和测试集，用训练集建立模型？还是先对整个集合进行变量压缩，再分训练集和测试集？ 4.是不是测试集只有在模型外部验证时候才派上用场， 变量压缩，模型建立等时候都不参与？  ，谢谢！[ Last edited by zeoliters on 2009-11-13 at 18:26 ] |
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3楼2009-10-15 17:12:05
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按照统计学要求，实际上有4个集合： （1）Training Set （自变量已知，因变量已知） （2）Validating Set （自变量已知，因变量已知） （3）Test Set（自变量未知，因变量未知） （4）Real-world Set（自变量未知，因变量未知） 而现在用于化学的QSAR/QSPR，发表论文时 （A）肯定还没有(4) （B）也没有（3） （C）于是把（1）和（2）混起来 （D）再划分为Training Set和Test Set，玩儿过家家。 你说，该怎么操作？ |
5楼2009-10-15 23:02:50
bbslover
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