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shucaiyuanyi

银虫 (小有名气)

[交流] 两个蛋白质只有几个aa的差别,怎么分析? 已有1人参与

如题,怎么在蛋白结构,构像等分析?
或者有什么好的分析软件或网站,推荐一下,谢谢大家
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shucaiyuanyi

银虫 (小有名气)

自己顶一下,继续求助
2楼2009-10-16 20:59:45
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jjlbest

木虫 (著名写手)


shucaiyuanyi(金币+1):谢谢参与
可以在网上用Swiss-model进行分析,看看蛋白的空间结构是不是发生了变化。
3楼2009-10-22 14:10:15
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Entrez1110


shucaiyuanyi(金币+1):谢谢参与
这个aa是属于什么类型的aa, 蛋白质的空间结构怎么样,这些aa在肽链的什么位置?是否影响空间结构?
4楼2009-10-22 15:51:50
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)


shucaiyuanyi(金币+1):谢谢参与
蛋白结构是测定出来的,一般来说,分析出来的结果意义不大
5楼2009-10-22 16:34:40
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liugaobo1979

铁虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
shucaiyuanyi(金币+1):谢谢参与
shucaiyuanyi(金币+1,VIP+0): 11-3 23:33
shucaiyuanyi(金币+5,VIP+0): 12-1 18:01
兄弟:我试着帮你出出注意。
        我想知道你想分析的是什么,你是想知道2种蛋白具体差什么氨基酸还是差了氨基酸后对2种蛋白的结构引起什么样的差别?如果是前一种,那你只能采用edman降解法从蛋白质的N端开始足一测出蛋白质氨基酸的组成直到测出俩种氨基酸的差别为止。如果是第二种,就要看差了什么氨基酸,差在什么位置,如果差的是脯氨酸或半胱氨酸,影响有可能会大,因为半胱氨酸可能形成二硫键,而脯氨酸控制蛋白脸的转弯,这俩种氨基酸对蛋白结构影响比较大,其他氨基酸影响较少。如果你想知道二者构像差别,可以用元二色谱鉴定,如果因氨基酸不同引起糖基化差别,可以用糖苷酶切+SDS-PAGE,或者用肽图分析。
6楼2009-10-22 17:11:01
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louyiceng

荣誉版主 (知名作家)


shucaiyuanyi(金币+1):谢谢参与
7楼2009-12-06 15:55:55
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anquren

金虫 (正式写手)


shucaiyuanyi(金币+1):谢谢参与
至于怎么分析取决于你想分析什么,
8楼2009-12-06 18:25:38
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louyiceng

荣誉版主 (知名作家)

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by jjlbest at 2009-10-22 14:10:15:
可以在网上用Swiss-model进行分析,看看蛋白的空间结构是不是发生了变化。


谢谢
9楼2010-04-07 22:16:53
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