| 查看: 1668 | 回复: 1 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者sxsfdx将赠送您 20 个金币 | ||
[求助]
[求助] 【gromacs】如何计算胶束质心和另外一个分子的RDF 已有1人参与
|
||
|
[求助] 【gromacs】如何计算胶束质心和另外一个分子的RDF 我有一个胶束（由40个分子A组成），还有一个药物分子B，请问如何计算胶束质心和药物分子质心之间的RDF？ gmx rdf -f trajout.xtc -s md1.tpr -n index.ndx -ref “com of group A” -sel “com of group B” -bin 0.03（这个命令得到的rdf和实际情况 不符合） 其中trajout.xtc 采用的下面的命令，已经让胶束和药物分子居中盒子了。 gmx trjconv -f md1.xtc -pbc cluster -center -s md1.tpr -n index.ndx 谢谢大家！ |
回复此楼» 猜你喜欢
估计是周四
已经有3人回复
-
基金啊基金
已经有3人回复
-
科研孤儿太难了
已经有15人回复
-
让我中一个面上吧！
已经有10人回复
-
言之凿凿，明天官网会通知放榜？
已经有17人回复
-
时间戳又变了
已经有17人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有11人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有23人回复
-
只有每年这种时候来逛逛小木虫
已经有22人回复
-
放榜前的不淡定
已经有12人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
visualization
金虫 (小有名气)
- 应助: 23 (小学生)
- 金币: 3114.4
- 散金: 678
- 帖子: 196
- 在线: 352.8小时
- 虫号: 494396
- 注册: 2008-01-13
- 专业: 理论和计算化学
2楼2024-09-10 00:38:12
40