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梧桐眼

金虫 (著名写手)

[交流] 求助:关于基因克隆

大家好:
      我一直在做一个蛋白酶基因的克隆现在有了片段序列(片段长度900bp左右)在Genbank上比照后发现其与一同属的材料的同源蛋白基因组序列具有高度相似性(98%)。现在我想既然是同属的片段相似度很高是否可以直接通过已知的序列设计引物直接可用我的蛋白基因序列!片段长度大约2000bp。
      我的这个想法是否可行?希望大家指导!在下在线等!
、                  
                                                     祝:实验顺利,身体健康
                                                     虫友:梧桐眼上
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铜虫 (正式写手)

实验方案合乎逻辑!
6楼2009-10-13 22:37:58
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你把最相近的10个序列下载下来,比对下,寻找保守区域,以那个地方设计引物,会好点。
小木虫之有关部门负责人
2楼2009-10-13 14:38:38
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梧桐眼

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by scelab at 2009-10-13 14:38:
你把最相近的10个序列下载下来,比对下,寻找保守区域,以那个地方设计引物,会好点。

在已有的片段序列中 我的材料和已知的序列基本都能配上 !我对的意思是我能不能在已知的那种菌的蛋白编码序列上找序列作为引物直接用到我的材料上,获得几段序列后拼接成我要的蛋白编码序列  我的材料和已知的那段序列是一个属法人真菌!
3楼2009-10-13 14:54:46
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 梧桐眼 at 2009-10-13 14:54:


在已有的片段序列中 我的材料和已知的序列基本都能配上 !我对的意思是我能不能在已知的那种菌的蛋白编码序列上找序列作为引物直接用到我的材料上,获得几段序列后拼接成我要的蛋白编码序列  我的材料和已知的 ...

你说的和一楼说的不是一样么?  只是他提醒你从保守序列入手设计特异性引物  pcr比较好扩增。
4楼2009-10-13 15:38:25
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