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danielljb

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【交流/求助】用iPSORT来确定protein的线粒体targeting sequence

今天看文献,他们用iPSORT确定了NCT蛋白的N terminus有一个ER targeting domain,跟着有一个mitochondrial targeting sequence。
我想问一下大家,有么有用这个ipsort的?有什么经验可以介绍一下吗?
还有就是关于signal sequence 不一定在N端,用这个iPSORT可以把自己的蛋白序列一点点从N端删除(比如一次5个),来看看蛋白中哪一段有signal sequence吗?以及mitochondrial targeting sequence可以在蛋白的中间位置吗?

[ Last edited by amisking on 2010-1-1 at 19:37 ]
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qqsvery

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼主是研究哪一块的?发现几天没上论坛,你这个问题不太了解,也想了解一二!
谎言和真实在河边洗澡,谎言先洗好,穿走了真实的衣服,真实却不肯穿谎言的衣服。后来人们眼里只有穿着真实衣服的谎言,却很难接受赤裸裸的真实。
2楼2010-01-01 13:09:13
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danielljb

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by qqsvery at 2010-1-1 13:09:
楼主是研究哪一块的?发现几天没上论坛,你这个问题不太了解,也想了解一二!

你好,我是研究蛋白质相互作用的。
http://hc.ims.u-tokyo.ac.jp/iPSORT/这是IPSORT的地址。
上面有介绍。
Regards,
3楼2010-01-02 13:35:51
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