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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【讨论】分子力学、分子动力学、蒙特卡洛、方法的区别于联系
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...

[交流] 【讨论】分子力学、分子动力学、蒙特卡洛、方法的区别于联系 已有1人参与

这几个概念一直模模糊糊的。

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:41 ]
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第一性原理 仿真建模与计算 分子动力学

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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
1楼 2009-10-12 10:02:08
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★ ★ ★
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lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 10-12 16:46
老汉的比喻很恰当, 只是这个比正统的定义还要难理解.

MM告诉你,一个分子或体系, 在某个构象下的能量值
MD和MC则是寻找能量最低值的方法
当体系的原子数较多,自由度较大时候,
用单纯的优化方法极容易走到local minima 里面,
怎么从local minima 中走出来,
MD 期望用原子热运动, 在local minima里面乱撞
MC 期望用对能量变高的构象变化有一定的概率接受

这些都是MD和MC 早期的概念, 当时是计算非平衡性质的,
现在都在计算平衡性质

另一种说法,
MC实现的是Gibbs 的统计力学, MD实现的是玻父的统计力学

[ Last edited by bay__gulf on 2009-10-12 at 17:27 ]
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5楼2009-10-12 13:31:17
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人
★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 10-12 11:58
仔细读一读陈敏伯《计算化学-从理论化学到分子模拟》，这本书很不错，我刚买。解决了不少小的概念问题。不过还没看完，呵呵
其实随便一本关于分子模拟的书都讲了，自己好好读读书，别太懒了

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-12 at 10:56 ]
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2楼2009-10-12 10:31:47
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

如果把你看成分子们的话，那么

★ ★ ★ ★ ★
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lei0736(金币+3,VIP+0):呵呵 10-12 11:59
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):睿智的老汉！让我怎样崇拜你？！解释的太漂亮了 10-12 13:21
分子力学告诉你，你是由骨头、皮肉和水组成的。
分子动力学告诉你，骨头是如何在皮肉里起到支撑作用免得你摊成一个肉片儿，以及水在你的皮肉里是怎么运动的。
蒙特卡罗试着用骨头撑起你的皮肉，试着让水在你的皮肉里分布、运动，看你能不能活。
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3楼2009-10-12 11:37:41
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
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引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2009-10-12 11:37:
分子力学告诉你，你是由骨头、皮肉和水组成的。
分子动力学告诉你，骨头是如何在皮肉里起到支撑作用免得你摊成一个肉片儿，以及水在你的皮肉里是怎么运动的。
蒙特卡罗试着用骨头撑起你的皮肉，试着让水在你的皮肉里分布、运动，看你能不能活。

睿智的老汉！让我怎样崇拜你？
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4楼2009-10-12 13:21:16
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