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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 怎样确定基因的转录起始位点
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ivyxiao

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 银杏下 at 2009-10-11 09:22:
LZ注意转录起始位点并不是从ATG开始的，ATG只是翻译起始位点，一般转录起始位点位于启动子和核糖体结合位点（rbs序列）之间，在E.coli中rbs序列之前30-40bp左右就包含了启动子，不同物种会有差异。

谢谢你的解答，我想从基因组中扩增某蛋白的启动子，所以想知道启动子的序列是不是扩增ATG前面1-2Kbp片段就可以了。
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21楼2009-10-11 21:38:03
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ivyxiao

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yuehuashou at 2009-10-11 10:32:
mRNA合成以后存在剪切，成熟mRNA的第一个碱基不一定是转录的起始碱基。

谢谢您的解答
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22楼2009-10-11 21:40:52
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ivyxiao

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zuodongyun at 2009-10-11 10:23:
转录不是从ATG开始的，在没有实验分析的情况下，只有通过生物信息学的相关软件分析，预测转录起始位点，在根据预测结果设计实验验证

谢谢您的解答，请问能推荐一下相关的分析软件预测转录起始位点吗？
对于如何分析我确实有点不大明白。希望您能指点一二
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23楼2009-10-11 21:46:24
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ivyxiao

金虫 (正式写手)
帖子沉下去了  
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24楼2009-10-19 17:41:32
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tf1984

新虫 (初入文坛)
★
ivyxiao(金币+1):谢谢参与
是真核的还是原核的？
可以判断其启动区，例如原核的ATAT盒啊之类的东西
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25楼2009-10-19 19:01:25
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jiaminl

铁杆木虫 (知名作家)
★
ivyxiao(金币+1):谢谢参与
路过顶一下
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Nevergiveup!
26楼2009-10-25 10:41:43
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louyiceng
★
ivyxiao(金币+1):谢谢参与
顶一下
27楼2010-03-22 11:21:16
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虫子火箭兵

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
一般来说起始密码ATG开始转录，可以使用VECTOR等软件分析序列，找到ORF
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28楼2010-03-22 16:52:38
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