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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 系统发育树构建
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SL_Alive

新虫 (初入文坛)

[求助] 系统发育树构建 已有2人参与

为什么在ncbi上比对是100%，但是下载下来建树，聚不到一块，树形也很奇怪。求解决方法

@天使托 发自小木虫IOS客户端
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1楼 2023-10-26 23:05:07
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xiaoys66

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

下载与你的菌株相似菌株的序列，然后再下载一个不太相似的作为外群，外群作为根。聚不到一块也正常，有的菌（比如芽孢，分类就很乱）
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2楼2023-11-14 10:57:25
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hutil1543

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

identity是100%不代表就是一样的，还需要看coverage，覆盖率越高越相似。另外你需要它们聚在一起可以加入一个相似度低的。
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3楼2023-11-16 08:31:41
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