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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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phaha

新虫 (小有名气)

[求助] 求教单螺旋直链淀粉MS建模

请问有人做淀粉的分子动力学仿真吗,卡在第一步直链淀粉的建模了(想建一个50个单体左右的),pdb数据库中没有合适的单螺旋支链淀粉模型,自己用build polymer中的repeat unit和homopolymer建的时候发现总是形成不了良好的直螺旋,不管是用单体聚合还是用从双螺旋中解出的12个单元的短链单螺旋聚合,请问各位有知道是怎么回事的吗,指教一下,如果有直链淀粉的模型文件,mol2或者xsd,那就更好了,万分感谢!@oxox6085@smutao
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错过了她。

新虫 (著名写手)

我也是琢磨了好久自己建的,单螺旋直链结构好几个平台都能建。

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2楼2024-01-17 20:35:26
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phaha

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 错过了她。 at 2024-01-17 20:35:26
我也是琢磨了好久自己建的,单螺旋直链结构好几个平台都能建。

请问单螺旋的怎么建啊,建出来的螺旋结构总是不太好,要不就是没有疏水腔
3楼2025-04-15 19:11:39
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