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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【讨论】outlier去除后，还需要重新计算描述符吗？
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bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】outlier去除后，还需要重新计算描述符吗？

outlier的存在会使相关性变差，去除后模型的相关性会变好。于是有个问题，比如我有72个化合物，经过计算这72个化合物的描述符，再经过统计回归，发现有3个是outlier，这时我要去掉这3个，那么我是否还要重新计算剩下的69个的描述符，然后在进行统计呢？ 还是不用计算了，就用第一次计算的结果，只是把这3个outlier去掉就行了呢？
谢谢！

[ Last edited by zeoliters on 2009-11-13 at 18:30 ]
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1楼 2009-10-09 17:45:38
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mingdong(金币+3,VIP+0):感谢交流！ 10-9 20:57
描述符是一个分子一个分子计算的，除去Outlier，与分子的描述符无关，不需要重新计算。
但是，由于除去Outlier，那么描述符的“矩阵”发生变化，最大最小值，偏差等，都不同了。
因此，建立模型的过程，如归一化处理等，都要重新进行。
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2楼2009-10-09 20:26:03
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bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2009-10-9 20:26:
描述符是一个分子一个分子计算的，除去Outlier，与分子的描述符无关，不需要重新计算。
但是，由于除去Outlier，那么描述符的“矩阵”发生变化，最大最小值，偏差等，都不同了。
因此，建立模型的过程，如归一化 ...

这个是关于2D的，那么3D的outlier去除后，还需要重新叠合吗？ 是不是去除outlier后的，所有分子还需要重新叠合下？
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3楼2009-10-09 22:18:30
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
当然要重新叠合
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4楼2009-10-09 22:40:30
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bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2009-10-9 22:40:
当然要重新叠合

这个知道了，那写论文的时候，如何列出预测的值呢？ 因为第一次计算比如（comfa）得到预测值，通过这些值可以判断出哪些是outlier，那这些第一次计算的结果是不是要列出来啊？ 通过列出来的表说明哪些是outlier，那去除outlier之后，还要重新叠合，重新计算，得到的结果还要再列出一个表格吗？ 看到paper上常常就说哪些是outlier，似乎没有重新计算呢？ 不知道我理解的对不？
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5楼2009-10-09 23:14:12
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