24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 736  |  回复: 4
当前主题已经存档。

pengxin8086

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 请教一个关于Clustal W 的问题

各位高手,想请教一个关于Clustal W 的问题,我就是在文献上见到人家用这个软件分析蛋白质的序列,得到如下的结果:
Sequence alignment using CLUSTAL W , shows that there is a higher sequence similarity between these two proteins and extended EF-hand proteins relative to sequences of compact proteins. Sequence identity of
bovine calmodulin is higher than 60% with sequences of extended structures while it is only 20% with sequences
of compact structures. In case of EhCABP, there is about 28% sequence identity with sequences of extended structures and only 15% with those for compact ones。
我就是想问怎么用这个软件得出两个或者多个蛋白质序列的相似性结果,具体来说就是怎么用这个软件得到蛋白质序列相似度(就是它们之间的相似百分数)。因为自己才开始学习这个软件,所以有些东西不太懂。在此先谢谢了! 这篇文献是2008 Fractal aspects of calcium binding protein structures。
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

boouy

银虫 (正式写手)


pengxin8086(金币+1,VIP+0):谢谢了 能否具体点? 10-8 09:19
有相似矩阵结果,可以用bioedit等软件本地化完成。
2楼2009-10-08 02:38:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pengxin8086

铁杆木虫 (著名写手)

boouy  你能否说的具体的?
3楼2009-10-08 09:19:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

boouy

银虫 (正式写手)

★ ★ ★
pengxin8086(金币+1,VIP+0):谢谢了,看样子你理解错了我的意思,我是说要你用clustalW说具体一下。 10-11 20:11
amisking(金币+2,VIP+0): 10-12 08:15
引用回帖:
Originally posted by pengxin8086 at 2009-10-8 09:19:
boouy  你能否说的具体的?

attached!
4楼2009-10-09 10:33:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

boouy

银虫 (正式写手)

★ ★
pengxin8086(金币+2,VIP+0):哦,谢谢了! 10-12 08:45
bioedit有clustalW功能,序列比对后可以查到相似矩阵结果。
5楼2009-10-12 01:51:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pengxin8086 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料299专硕求调剂 +13 +21 2026-04-09 13/650 2026-04-13 14:16 by 张zhihao
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +9 升格阿达 2026-04-12 9/450 2026-04-13 14:12 by maddjdld
[考研] 考研求调剂 +9 子木呐 2026-04-12 9/450 2026-04-13 13:57 by maddjdld
[考研] 2本,初试303,0860求调剂 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 求调剂 +11 月@163.com 2026-04-07 13/650 2026-04-11 22:55 by BruceLiu320
[考研] 一志愿厦大0856,306求调剂 +15 Bblinging 2026-04-11 15/750 2026-04-11 22:53 by 314126402
[考研] 284求调剂 +11 archer.. 2026-04-09 12/600 2026-04-11 20:23 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +10 璃茉一定上岸 2026-04-10 10/500 2026-04-11 13:31 by 1005715100
[考研] 298求调剂 +5 残荷新柳 2026-04-07 5/250 2026-04-11 11:02 by 紫曦紫棋
[考研] 283求调剂 +22 那个噜子 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 10:41 by 逆水乘风
[考研] 工科273调剂 +6 X1999 2026-04-09 7/350 2026-04-11 10:23 by zhq0425
[考研] 一志愿211,化学310分,本科重点双非,求调剂 +23 努力奋斗112 2026-04-08 23/1150 2026-04-10 23:29 by 314126402
[考研] 一志愿矿大,材料工程专硕314分,0856可调都可以 +15 无懈可击的巨人 2026-04-09 15/750 2026-04-10 18:10 by hmn_wj
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[考研] 材料专硕调剂 +16 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-07 17/850 2026-04-09 21:16 by wutongshun
[考研] 332,085601求调剂 +12 ydfyh 2026-04-09 14/700 2026-04-09 17:28 by wp06
[论文投稿] 求助文献原文 10+3 18500821399 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:56 by 北京莱茵润色
[考研] 求机械专硕297第二批调剂 +5 拾柒12。 2026-04-08 5/250 2026-04-09 16:43 by 允当适度
[考研] 生物学学硕,初试351分,求调剂 +4 …~、王…~ 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:49 by limeifeng
[考研] 材料工程专业日语生求调剂 +9 111623 2026-04-07 9/450 2026-04-07 23:31 by 一只好果子?
信息提示
请填处理意见