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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

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[交流] 【调查】GaussianFAQ第三次征集答案(30金币奖励)

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[ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-7 at 17:12 ]
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a349857460

木虫 (著名写手)

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yjcmwgk(金币+0,VIP+0):请参考http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1566146的回答方式。您这样回答,不可能是最佳答案 10-7 16:27
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1. 对于一个优化计算,它的过程是先做一个SCF计算,得到这个构型下的能量,然后优化构型,再做SCF,然后再优化构型。。。因此,会有两种不收敛的情况:一是在某一步的SCF不收敛(L502错误),或者构型优化没有找到最后结果(L9999错误)。
(1)对于SCF不收敛,通常有以下的解决方法:
a. 使用小基组,或低级算法计算,得到scf收敛的波函数,用guess=read读初始波函数。
b. 使用scf=qc,这个计算会慢,而且需要用stable关键字来测试结果是否波函数稳定。如果这个还不收敛,会提示L508错误。
c. 改变键长,一般是缩小一点,有时会有用。
d. 计算相同体系的其他电子态,比如相应的阴离子、阳离子体系或单重态体系,得到的收敛波函数作为初始猜测进行计算。

(2). 对于优化不收敛,即L9999错误,实际上是在规定的步数内没有完成优化,即还没有找到极小值点。(或者对于过渡态优化,还没有找到过渡态)
这有几种可能性:
a. 看一下能量的收敛的情况,可能正在单调减小,眼看有收敛的趋势,这样的情况下,只要加大循环的步数(opt(maxcycle=200)),可能就可以解决问题了。
b. 加大循环步数还不能解决的(循环步数有人说超过200再不收敛,再加也不会有用了,这虽然不一定绝对正确,但200步应该也差不多了),有两种可能。一是查看能量,发现能量在振荡了,且变化已经很小了,这时可能重新算一下,或者构型稍微变一下,继续优化,就可以得到收敛的结果当然也有麻烦的,看运气和经验了);二是构型变化太大,和你预计的差别过大,这很可能是你的初始构型太差了,优化不知道到哪里去了,这时最好检查一下初始构型,再从头优化。
c. 对于L9999快达到收敛时,考虑减小优化步长有时对于能量振荡的情况也是有用的,opt(maxstep=1).(flyingheart )一个建议是,对于大体系,难收敛体系,先用小基组,低精度算法优化一下,以得到较好的初始构型,再用高精度的计算接着算。如果前面的方法保留了chk文件,重新计算时需要使用 geom=allcheck 读入构型(就不必麻烦地写构型了), guess=read(读入初始波函数,可以加快第一步SCF收敛)。
引用网页:http://bbs.theochem.net/viewthread.php?tid=20

2.writwa错误突然中断
硬盘问题,两种情况:
      一种是你使用的是32位的系统或Gaussian软件,那么你的计算最多只能写16GB的硬盘空间,即使你的电脑剩余空间再多,需要的空间超过了16G也要出错,如果是这样的,在命令行尝试使用maxdisk=2000mw关键词,也许会解决问题,如果不行,你只能找64位的版本来做计算了。windows下使用老版本的gaussian作计算时还会出现单个文件2G的限制,这时需要在将这16G拆分成8个左右的磁盘读写文件。在命令行的上面添加
%rwf=name1.rwf,name2.rwf,name3.rwf.......这里的文件名随便起
     另一种情况是你的系统和软件是64位的,这种情况下如果你没有定义最大硬盘,gaussian就会无限的写下去,直到满足要求为止,这时经常会出现硬盘被写满的情况,也就是你的硬盘没有空间了,此时同样需要定义maxdisk关键词,容量至少要比你的硬盘剩余空间小一些。
引自:http://blog.163.com/lhwhxu/blog/static/10253754120097792051215/

[ Last edited by a349857460 on 2009-10-7 at 16:33 ]
2楼2009-10-07 16:12:50
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flash8407

木虫 (正式写手)


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L9999应该是步数不够,把结构保存再继续算下去就可以了
3楼2009-10-07 16:23:18
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liuchun521

铁杆木虫 (著名写手)

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1  答: 是属于构型优化没有找到最后结果,即在规定的优化步骤内没有找到最终的合适的结构。(L9999错误)。

对于优化不收敛,即L9999错误,实际上是在规定的步数内没有完成优化,即还没有找到极小值点。(或者对于过渡态优化,还没有找到过渡态),可以增加优化步骤,或是拿最后的结构 接着进行优化。

此外这有几种可能性:
1. 看一下能量的收敛的情况,可能正在单调减小,眼看有收敛的趋势,这样的情况下,只要加大循环的步数(opt(maxcycle=200)),可能就可以解决问题了。
2. 加大循环步数还不能解决的(循环步数有人说超过200再不收敛,再加也不会有用了,这虽然不一定绝对正确,但200步应该也差不多了),有两种可能。一是查看能量,发现能量在振荡了,且变化已经很小了,这时可能重新算一下,或者构型稍微变一下,继续优化,就可以得到收敛的结果(当然也有麻烦的,看运气和经验了);二是构型变化太大,和你预计的差别过大,这很可能是你的初始构型太差了,优化不知道到哪里去了,这时最好检查一下初始构型,再从头优化。
3. 对于L9999快达到收敛时,考虑减小优化步长有时对于能量振荡的情况也是有用的,opt(maxstep=1).(flyingheart )

一个建议是,对于大体系,难收敛体系,先用小基组,低精度算法优化一下,以得到较好的初始构型,再用高精度的计算接着算。如果前面的方法保留了chk文件,重新计算时需要使用 geom=allcheck 读入构型(就不必麻烦地写构型了), guess=read(读入初始波函数,可以加快第一步SCF收敛)。
4楼2009-10-07 16:28:40
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liuchun521

铁杆木虫 (著名写手)

(2)答   你的结构在优化到某一部的时候的SCF不收敛(L502错误)

预备知识:计算时保存chk文件,可以在后续计算中使用guess=read读初始猜测.

对于SCF不收敛,一般有一下几种的解决方法:
1. 使用小基组,或低级算法计算,得到scf收敛的波函数,用guess=read读初始波函数。
2. 使用scf=qc,这个计算会慢,而且需要用stable关键字来测试结果是否波函数稳定。如果这个还不收敛,会提示L508错误。
3. 改变结构(键角,键长等),这个很重要,需要经验的积累。
4. 计算相同体系的其他电子态,比如相应的阴离子、阳离子体系或单重态体系,得到的收敛波函数作为初始猜测进行计算。
5. 加入一些关键字。如:guess=core 等
6. 放低收敛的精度要求。
7.
5楼2009-10-07 16:33:27
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liuchun521

铁杆木虫 (著名写手)


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3  答
  是内存问题  可以增加内存  或是调整机器的内存。
  或是硬盘问题,两种情况:
一种是你使用的是32位的系统或Gaussian软件,那么你的计算最多只能写16GB的硬盘空间,即使你的电脑剩余空间再多,需要的空间超过了16G也要出错,如果是这样的,在命令行尝试使用maxdisk=2000mw关键词,也许会解决问题,如果不行,你只能找64位的版本来做计算了。windows下使用老版本的gaussian作计算时还会出现单个文件2G的限制,这时需要在将这16G拆分成8个左右的磁盘读写文件。在命令行的上面添加
%rwf=name1.rwf,name2.rwf,name3.rwf.......这里的文件名随便起
另一种情况是你的系统和软件是64位的,这种情况下如果你没有定义最大硬盘,gaussian就会无限的写下去,直到满足要求为止,这时经常会出现硬盘被写满的情况,也就是你的硬盘没有空间了,此时同样需要定义maxdisk关键词,容量至少要比你的硬盘剩余空间小一些。

参考来自:http://blog.163.com/lhwhxu/blog/static/10253754120097792051215/
6楼2009-10-07 16:45:31
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