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稀客呀888

新虫 (初入文坛)

[求助] 用试剂盒提取细菌基因组测序显示无信号或者信号衰退,读序短请问是什么原因呢 已有2人参与

用试剂盒革兰氏阴性提法提取了细菌的基因组,pcr 前测了od 值并且跑了小孔凝胶,凝胶很亮,pcr 之后跑了大孔凝胶,凝胶也很亮,送去测序结果是无信号或者信号衰弱,读序短,测序公司说可能是纯化时候盐离子过多,会是这个原因吗,还是因为用错了方法?应该用阳性提法吗???求各位大神给我解答一下,万分感谢!

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dehong1573

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

用sanger测序测基因组?还是测PCR产物?测PCR产物让测序公司帮纯化就可以。
科学永无止境,只有合作共享才能更好地……
2楼2023-07-26 08:39:35
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ffplant

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

基因组用琼脂糖胶电泳检测了吗?上样孔有没有明显的白色残留痕迹?
3楼2023-07-26 11:28:27
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稀客呀888

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ffplant at 2023-07-26 11:28:27
基因组用琼脂糖胶电泳检测了吗?上样孔有没有明显的白色残留痕迹?

没有

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4楼2023-07-28 23:58:27
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稀客呀888

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ffplant at 2023-07-26 11:28:27
基因组用琼脂糖胶电泳检测了吗?上样孔有没有明显的白色残留痕迹?

用凝胶电泳测了,上样口没有残留痕迹

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5楼2023-07-28 23:59:37
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