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免提取DNA直扩方法与应用心得 ----兼容SNP荧光终点法(Flu-ARMS或KASP),电泳PCR
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高通量提取DNA做PCR,SSR,SNP检测如Flu-ARMS或KASP动辄上千个样品,用柱子提取花费太高,离心耗时太多,通量上不去。磁珠法需要配合自动提取仪,对设备要求高。目前绝大部分实验室还是使用传统的CTAB法或者其相关简化版方法,只要用普通化学试剂,成本便宜,但需要酒精沉淀,烘干,操作还是略微需要一定时间。提DNA是必须的吗? 固德生物推出免提取DNA直扩方法和直扩裂解试剂,不用任何提取步骤,只需: 1. 取 2cm长水稻叶片,在 96深孔板里,加 5mm钢珠一颗,加 400ul直扩裂解液; 2. 高通量研磨机 1400rpmX40S; 3. 吸取 10ul研磨液体至 90ul水中,混匀,直接上机(DNA在体系中加量常在 20%~50%, 推荐为 50%)。 以上步骤10分钟内就可以完成96*2份样本处理。一天可以处理上近万份样本,高效快捷。 无需提取DNA,从取样到PCR结束,只需要一个小时, PCR结束无论是看SNP荧光分析还是SSR电泳跑胶都适用 试剂不含强碱裂解液,比碱煮法更柔和,通用性更强。 轻松完成水稻、玉米、小麦、拟南芥,农杆菌,培养细胞,血液等样本的大规模DNA提取 案例: PCR+荧光做SNP检测:水稻叶片用直扩裂解液研磨后上清稀释15倍,配合固德生物Flu-ArmsTM SNP分子标记检测试剂,PCR后荧光扫描进行基因分型 (此方法用普通PCR+荧光定量或扫描仪大规模做SNP分析,通量高,操作简单) PCR+电泳做SNP检测:油菜叶片用直扩裂解液研磨后上清稀释15倍,配合固德生物PG-ArmsTM SNP分子标记检测试剂,PCR后做8%PAGE电泳进行基因分型。(此方法用普通PCR+电泳设备就能大规模做SNP分析,不需要荧光定量PCR仪。适合SSR转SNP方法。转型简单,成本底) PCR+电泳做片段检测:油菜叶片用直扩裂解液研磨后上清稀释10倍,PCR后做琼脂糖电泳 |
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