| 查看: 4073 | 回复: 34 | ||||
| 【奖励】 本帖被评价23次，作者qiangwxr增加金币 21 个 | ||||
| 当前主题已经存档。 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[资源]
【原创】Windows下使用Gaussian小结
|
||||
|
以前看文献时经常看到Gaussian，单位购买的是Materials Studio。为了重复文献工作，验证MS Dmol3优化结果，特别是想试试传说中特别精确的B3LYP函数。一周前开始尝试使用Gaussian，碰到很多问题，到处发贴询问，现在总算熟悉了一点。总结一下，希望给同样想在Windows下使用Gaussian的初学者提供一点参考。 一、Gaussian 03w几种版本的下载 二、Gaussian 03w的并行计算 三、Gaussian 03w与Materials Studio的连接 四、Gaussian 03w与Chem3D的连接 一、Gaussian 03w几种版本介绍 网上最容易找到并下载的是03w B01版本（Gaussian 03W-For Vc.rar），下载地址应该很好找。 其它版本比较难找，纳米盘之类的网站我基本上没有下载成功过。 我最后是从科学网下载到E01的（直接安装包，不是升级补丁）：http://www.sciencenet.cn/bbs/showpost.aspx?id=62263 在办公室一直下不了，可能是局域网通过代理浏览网页的原因。在家里用TD上网，虽然速度慢一点，下载还比较稳定。如果有人下不了，可以通过邮件或QQ传送文件。 昨天在单位服务器（Win2000 sp4）上安装G03w E01，无法计算，每次运行到l302.exe时就弹出报错对话框上写的是“Severe Error Message # 2070”，软件界面上的输出结果里看不到出错信息。难道不支持2000系统？，安装B01可以运行，但无法并行计算。刚刚在2000上用VMware安装一个虚拟精简版的xp，同样的问题。 二、Gaussian 03w的并行计算 感谢tangdy的帖子：http://www.mdbbs.org/viewthread. ... p;extra=&page=4 “E01可以并行的，把\G03W\Scratch\Default.Rou用记事本（一定要用记事本，utraedit不行）打开，然后在里面加入 -p- 4 （四核，双核为2），然后输入文件里面不要写%nproc，这样就可以采用共享内存模式并行。d01以上好像可以，我只试过e01版本，WinXP系统。” 补充说明：一个进程CPU占用可以达到100%，有点像WinRAR，而Materials Studio是分成几个相同名称的进程，加起来是100%。这可能就是内存共享模式。 B01版本是串行版本，只不过加上%nproce=n时不会报错而已，还是用的一个cpu核。 E01版本如果在输入文件里写%nproc=2，会提示出错：该本版是串行版本（%nproc=2 Will use up to 2 processors via shared memory. This is a serial version of G03.）。 三、Gaussian 03w与Materials Studio的连接 B01版本好像不能直接在MS里调用，运行后会很快报错，从菜单View->Project Log里可以看到，没有返回输出文件.gof。 可以通过在MS的Gaussian计算对话框里点File-Save File保存输入文件.ginf，然后用G03w打开（需显示所有文件）。生成的.out文件可以用GaussianView打开，保存为.mol文件，MS可以打开、导入和转换。 E01版本可以在MS里直接调用，但似乎不能使用并行计算。修改Default.Rou文件也没有用，可能MS没有用到这个配置文件。期待高手解决。 四、Gaussian 03w与Chem3D的连接 B01版本可以直接在Chem3D里调用，缺点是计算的时候Chem3D会完全占用一个CPU核（不显示计算进程也一样）。生成的.out文件可以用GaussianView打开，保存为.mol文件，Chem3D可以打开和转换。 [ Last edited by qiangwxr on 2009-10-10 at 10:33 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 量子化学资料 | Gaussian |
» 猜你喜欢
求助电催化剂制备，怎么在碳布表面生长PdCo合金
已经有0人回复
-
求助电催化剂制备，怎么在碳布表面生长PdCo合金
已经有1人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有77人回复
-
304求调剂
已经有5人回复
-
上海华东理工大学机械与动力工程学院先进材料与制造研究组招聘公告
已经有0人回复
-
304求调剂
已经有6人回复
-
304求调剂
已经有1人回复
-
一志愿985中药学306，求调剂
已经有0人回复
-
河南一本高校化学，材料，化工专业招收研究生
已经有0人回复
-
大连海事大学船舶洁净能源研究中心2026年博士研究生招生启事
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
6楼2009-10-04 13:51:17
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):欢迎分享原创经验 10-4 13:57
yjcmwgk(金币-2,VIP+0):奖励金币也已并入第一帖 10-5 10:57
yjcmwgk(金币-2,VIP+0):奖励金币也已并入第一帖 10-5 10:57
|
--deleted-- [ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-5 at 17:41 ] |
2楼2009-10-04 12:40:05
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):欢迎分享原创经验 10-4 13:57
yjcmwgk(金币-2,VIP+0):奖励金币也已并入第一帖 10-5 10:57
yjcmwgk(金币-2,VIP+0):奖励金币也已并入第一帖 10-5 10:57
|
--deleted-- [ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-5 at 17:42 ] |
3楼2009-10-04 12:40:42
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 10-4 13:58
yjcmwgk(金币-2,VIP+0):奖励金币也已并入第一帖 10-5 10:57
yjcmwgk(金币-2,VIP+0):奖励金币也已并入第一帖 10-5 10:57
|
--deleted-- [ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-5 at 17:42 ] |
4楼2009-10-04 12:41:06
