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shaopeng6539

[交流] 【求助】能量平衡问题如何解决

我用discover模块跑动力学,minimize设为最大步数,并且已经显示 收敛,可是跑动力学能量依然出现很大的上升趋势,致使得出的结果很不准确,请问大家在跑动力学能量和温度平衡问题是如何解决的,谢谢
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saitou

木虫 (正式写手)

★ ★
shaopeng6539(金币+1,VIP+0): 10-3 14:04
zxzj05(金币+1,VIP+0):鼓励讨论! 10-6 10:18
优化后的结构和平衡后的结构当然不一样,不然就不用MD了
不抛弃,不放弃
2楼2009-10-03 11:42:55
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shaopeng6539

引用回帖:
Originally posted by saitou at 2009-10-3 11:42:
优化后的结构和平衡后的结构当然不一样,不然就不用MD了

谢谢楼上的,可是想使能量和温度达到平衡又该这么办呢
3楼2009-10-03 14:05:38
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shaopeng6539

有人建议如果我用NPT系综,要使能量和温度平衡就先要进行NVT系综,是这样的吗,这是什么道理,能给解释下吗,谢谢
4楼2009-10-03 17:09:52
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qasd

木虫 (著名写手)


zxzj05(金币+1,VIP+0):鼓励讨论! 10-6 10:18
先用NVT调节一下密度,看看是否合适
5楼2009-10-04 16:41:31
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shaopeng6539

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-10-4 16:41:
先用NVT调节一下密度,看看是否合适

可是我跑完NVT发现晶胞常数和密度都不变呀,还有,如果我要先50k的NVT再NPT,当想在50K的基础上跑100k的NPT,我是直接在50K的NPT的结果上再100k的NPT?还是要先100k的NVT再100k的NPT呢,也就是每一次升温都要NVT一次吗还是只用一次的NVT呢?谢谢解答
6楼2009-10-05 09:51:39
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
shaopeng6539(金币+1,VIP+0): 10-6 08:50
zxzj05(金币+1,VIP+0):鼓励讨论! 10-6 10:18
这个是指用不同密度的NVT来测试,看看哪个平衡的更快些,以便确定NPT的初始密度和力场的正确性,后面就不用了,直接NPT就行
7楼2009-10-05 16:44:36
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shaopeng6539

8楼2009-10-06 08:50:10
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shaopeng6539

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-10-5 16:44:
这个是指用不同密度的NVT来测试,看看哪个平衡的更快些,以便确定NPT的初始密度和力场的正确性,后面就不用了,直接NPT就行

版主,先谢谢你,我想按照你的指点操作,可是最初我的温度T要设置为多少呢,比如我从50k开始升温,最初的NVT就设置为50k吗,谢谢
9楼2009-10-06 10:43:11
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qasd

木虫 (著名写手)

不涉及到高分子可以
10楼2009-10-06 22:28:48
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