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求助一下MS Forcite加电场的问题
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大佬们,我现在在做水溶液体系膜分离的分子动力学模拟,加入了电场,有以下几个问题请求大佬们解答! 1脚本中设置的电场强度比现实实验中的电场强度要大几个数量级,是因为模拟的时间尺度太小,因此需要加大电场强度在有限的模拟时间内获得明显离子的迁移效果吗? 2加入电场后,软件生成的energy.xcd文件中,体系的total energy和potential energy持续变负,是正常的吗?是因为电场持续向体系中输入能量导致体系能量越来越负吗?输入能量不应该越来越正吗? 3加入电场后,分析体系中离子的MSD,相同的盒子和模拟条件但是MSD复现性特别差,重复十几组计算,最大的斜率差能相差五六倍,这样正常吗?是体系初始化时速度的随机赋值导致的吗? 如有大佬能给予解答提供建议,感激不尽! 发自小木虫Android客户端 |
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lcx380
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