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bbslover金虫 (正式写手)
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[交流]
【讨论】还是对随机分训练集和测试集不懂！！！！
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paper经常说把数据集 随机 分成训练集和测试集，可是他们到底是怎么分的呢？ 1. 比如说，我共有72个化合物，我 随便选择出18个作为测试集，剩下的就作为训练集，这叫随机分吗？ 这18个测试集没有按照活性的均匀分布，也没有按照化合物结构的差异均匀分布，就是自己随便选择的18个，这叫随机吗？ 2. 如果叫做随机，建立的模型也不错，那别人也在这些化合物中随机选取18个（不一定和我的相同），得到的结果也不错，建立的模型也说得过去，那这么随机选取有什么意义呢？ 反正文章中常常说是随机分的，到底是怎么分的？ 高手帮忙详细分析一下吧！ 3. 随机选取有时候不能做到活性的再测试集和训练集均匀分布， 那么这么选取有按照活性的分布，和结构多样性分布好吗？ 4. 比如说，我这72个化合物，是该按照什么标准来分训练集和测试集呢？仅仅就根据活性就行吗？ 还是有其他的标准？？ 以上4个问题，希望战友们讨论一下。 [ Last edited by zdhlover on 2009-11-13 at 15:58 ] |
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(1) 按活性排队 从最高开始，奇数进训练、偶数进测试 或者：1、2进训练，3进测试，4、5进训练，6进测试... (2) 按“距离” 选择若干描述子，计算其“距离”（如欧几里德距离等，有很多种） 活性最高的，作为出发点，它本身进训练。 最近的一个进训练，其次的一个进测试； 再次的两个进训练，再再次的一个进测试； ...... (3) 按簇 按照类似(2)的做法，先把所有分子分簇（Cluster Analysis） 然后，每簇轮流出代表，进入测试、训练 (4) 学上帝，掷色子 |
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