24小时热门版块排行榜    

查看: 1903  |  回复: 2

1466036890

铜虫 (正式写手)

[求助] 求助利用molpro做CASPT2计算的输入文件 已有1人参与

求采用molpro软件的CASPT2输入文件,想采用CASPT2计算无能垒反应最低能量路径上各点的单点能,之前只是采用molpro做过显相关CC计算,从来没有做过CASPT2计算,希望虫友们给予帮助。
回复此楼
心若在,梦就在!!!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
1466036890: 金币+20, ★★★很有帮助, 已收到,非常感谢 2023-05-11 10:50:11
链接:https://pan.baidu.com/s/1yf4zrbVU8ZPnDrkKg-o-mQ?pwd=hgfk
提取码:hgfk
--来自百度网盘超级会员V9的分享

可以看看这个例子 之前算过的一个示例。
2楼2023-05-10 21:48:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1234zou

金虫 (小有名气)

还有另一种途径是不学习Molpro各种语法和功能,直接采用MOKIT程序黑箱、自动式的多参考计算,这里以两根O-H键均被拉长的水分子为例,写一个高斯gjf文件

%mem=4GB
%nprocshared=2
#p CASPT2/cc-pVDZ

mokit{CASPT2_prog=Molpro}

0 1
O   -0.23497692    0.90193619   -0.068688
H    1.26502308    0.90193619   -0.068688
H   -0.73568721    2.31589843   -0.068688

输入文件使用最常用的gjf格式,想要什么理论方法直接写(哪怕高斯不支持该方法也行,因为并不是仅调用高斯算的),符合书写直觉。中间CASPT2_prog=Molpro表示调用Molpro做CASPT2计算,一样符合直觉。用automr提交,命令如下

automr h2o.gjf >h2o.out 2>&1

仅20秒结束,不用肉眼看轨道、挑选轨道、做轨道局域化、大小基组投影、担心收敛性、调试关键词等各种曲折操作,直接算出来就是CASSCF(4,4)和CASPT2(4,4),程序会自动确定活性轨道是两根O-H的成键、反键轨道。h2o.out输出文件里有各个方法的电子能量、双自由基特征、未成对电子数等大量信息,直观清楚

E(CASCI)  =       -75.90802109 a.u.
E(CASSCF) =       -75.90823063 a.u.
----------------------- Radical index -----------------------
biradical character   (2c^2) y0=  0.165
tetraradical character(2c^2) y1=  0.139
Yamaguchi's unpaired electrons  (sum_n n(2-n)      ):  1.121
Head-Gordon's unpaired electrons(sum_n min(n,(2-n))):  0.607
Head-Gordon's unpaired electrons(sum_n (n(2-n))^2  ):  0.315
-------------------------------------------------------------
Leave subroutine do_cas at Sat Aug 12 14:46:05 2023


Enter subroutine do_mrpt2...
CASPT2 based on CASSCF orbitals.
Frozen_core = F, CASPT2 using program molpro
$molpro -t 1 -n 2 -m 250m h2o_uhf_gvb4_CASSCF_CASPT2.com

E(ref)       =       -75.90823031 a.u.
IP-EA shift  =         0.25 (default)
E(corr)      =        -0.13847648 a.u.
E(CASPT2)    =       -76.04670678 a.u.
Leave subroutine do_mrpt2 at Sat Aug 12 14:46:16 2023

另有fch文件可用GaussView和Multiwfn直接打开(不管你用什么量化程序算,都会给出fch文件,十分通用)
CASSCF初始轨道 h2o_uhf_uno_asrot2gvb4_s.fch
CASSCF收敛轨道,也是自然轨道 h2o_uhf_gvb4_CASSCF_NO.fch

MOKIT程序免费、开源,见https://gitlab.com/jxzou/mokit
中文简介见https://gitlab.com/jxzou/mokit/-/blob/master/README_zh.md
3楼2023-08-12 14:54:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 1466036890 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +11 枫桥ZL 2026-03-18 13/650 2026-03-22 20:26 by edmund7
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +6 生物工程调剂 2026-03-17 10/500 2026-03-22 20:22 by edmund7
[考研] 306求调剂 +6 chuanzhu川烛 2026-03-18 6/300 2026-03-22 19:39 by 公瑾逍遥
[考研] 293求调剂 +12 zjl的号 2026-03-16 17/850 2026-03-22 16:51 by i_cooler
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +3 niko- 2026-03-22 3/150 2026-03-22 15:15 by 杨杨杨紫
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:12 by 朱芷琳
[考研] 333求调剂 +5 87639 2026-03-21 7/350 2026-03-21 19:31 by ColorlessPI
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 22 350 本科985求调剂,求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 316求调剂 +6 梁茜雯 2026-03-19 6/300 2026-03-21 06:32 by Ecowxq666!
[考研] 070300化学319求调剂 +7 锦鲤0909 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:46 by JourneyLucky
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业(081702)315分求调剂 +12 yangfz 2026-03-17 12/600 2026-03-21 03:30 by JourneyLucky
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 环境工程调剂 +9 大可digkids 2026-03-16 9/450 2026-03-20 17:38 by 醉在风里
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
信息提示
请填处理意见