| 查看: 1092 | 回复: 2 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者是辣辣将赠送您 5 个金币 | ||
[求助]
想请教一下关于噬菌体的生物信息学分析的问题 已有1人参与
|
||
|
1.噬菌体进化树序列的筛选是用ncbi上blast出来的序列就可以达到建树的目的了吗，还是需要找其他菌属的噬菌体序列一起构建进化树，该怎么选择？ 2.做噬菌体的比较基因组学，应该选择什么样的序列去和目的噬菌体比较呢？ 对于这方面的知识还是菜鸟，希望大家帮帮忙解答~拜托了 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
生物质超级电容器
已经有0人回复
-
ALK5 高选择性小分子 LY-3200882：可放大合成路线与质控要点解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有153人回复
-
AM630（CAS 164178-33-0）：CB2 选择性配体的实验使用与供应要点
已经有0人回复
-
ADC标杆分子T-DM1全解析：从结构设计到实验室应用的技术要点
已经有0人回复
-
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做？
已经有0人回复
-
His标签蛋白纯化怎么才能快？
已经有0人回复
-
WRN变构抑制剂HRO761：从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析
已经有0人回复
-
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127：从三元复合物机制到科研应用
已经有0人回复
-
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib：从作用机制到科研试剂选型要点
已经有0人回复
-
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用
已经有0人回复
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
我想回答第一个问题，但因为我不是研究基因组学的，所以不能回答第二个问题。 用你自己的噬菌体序列在NCBI中BLAST得到的结果中，大多和你自己所研究的噬菌体亲缘关系较近，可能皆为同属甚至同种；所以如果想建立系统发育关系，还需要进一步找到不同属以及更高阶元的噬菌体物种的同源片段序列；找序列可以参考相近研究文献中所使用的物种序列号，这可以在文献的树图或者后附的SI中找到。 发自小木虫Android客户端 |
2楼2023-05-03 20:51:13
3楼2023-05-04 22:05:38