24小时热门版块排行榜    

查看: 784  |  回复: 8
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

qiangwxr

木虫 (小有名气)


[交流] 【求助】如何画出特定构型的分子模型?

具体如:两个四元环,有一个共同原子,四元环内角度是确定的,两个四元环的二面角也是确定的。这些固定值在结构优化是不能变。我用MS很难画出这样的分子模型,用Chem3D也没成功,很多原子没有定义的类型,不能优化。
    具体结构如下图:所有Cl-Ti-Cl键角为90度,两个四元环均为平面结构,两个四元环之间的二面角为90度。
    希望大家指点一下,困扰我很久了。
               Cl
                |
              Mg
              /    \
            Cl     Cl
             \      /
                Ti
              /    \
            Cl     Cl
             \      /
                Mg
                 |
                Cl
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiangwxr

木虫 (小有名气)


谢谢版主的回复
原子坐标一个个计算?很难让每个Cl-Ti-Cl键角都为90度,顾此失彼。想用AutoCAD,也不容易。MS没有考虑这种需求吗?
3楼2009-09-29 15:24:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
qiangwxr(金币+1,VIP+0): 9-29 15:25
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 10-1 22:43
这个可以先画再改原子坐标
优化时restraint
2楼2009-09-29 13:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenaihua

银虫 (小有名气)


wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 10-1 22:43
直接用ms建模里面的笔工具画就可以吧,之后再改
4楼2009-09-29 16:35:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

redskywei

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
qiangwxr(金币+3,VIP+0):谢谢,以前没用过3d selection。 9-30 08:11
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 10-1 22:43
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 10-1 22:44
平面的先画出来,这时候两个环间平面角180度,再在ms中用3d selection选中某一个平面,最后用movement工具旋转(角度可随意设定的)得到你想要的角度即可。
坠入无边的网~~
5楼2009-09-29 21:13:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见