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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 热点前沿问题讨论 » 有在用 callypso的大神吗 ，d12 的值怎样确定 ？
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大力2010

金虫 (著名写手)

[求助] 有在用 callypso的大神吗 ，d12 的值怎样确定 ？ 已有2人参与

有在用 callypso的大神吗  请教一下，Incar.dat里面，d12 的值怎样确定？  
@DistanceOfIon
d11 d12
d21 d22   


比如BN。建立一个方框，导入B 和 N原子，进行结构优化，优化后，键长就是d12的值吗？ 就是两个原子间 DISTANCE的值吗？
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1楼 2023-04-20 15:41:44
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中科小科虫

禁虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
nono2009: 金币-100, 应助指数-1, 屏蔽内容, 违规存档, 违规广告 2023-04-20 20:36:32
本帖内容被屏蔽
2楼2023-04-20 17:42:06
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
比两个原子共价半径之和稍小10%
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3楼2023-04-21 08:04:24
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大力2010

金虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2023-04-21 08:04:24
比两个原子共价半径之和稍小10%

比如BN。建立一个方框，棱长30 A，导入B 和 N原子，进行结构优化，优化后，键长就是d12的值吗？ 就是两个原子间 DISTANCE的值吗？
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4楼2023-04-21 10:06:42
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 大力2010 at 2023-04-21 10:06:42
比如BN。建立一个方框，棱长30 A，导入B 和 N原子，进行结构优化，优化后，键长就是d12的值吗？ 就是两个原子间 DISTANCE的值吗？...

何必那么麻烦，去元素周期表中直接找B和N的半径，不是更方便吗？初猜结构，没有那么重要的
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5楼2023-04-22 21:02:46
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大力2010

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2023-04-22 21:02:46
何必那么麻烦，去元素周期表中直接找B和N的半径，不是更方便吗？初猜结构，没有那么重要的...

我的想预测的相结构可能含有7个   14  个    28  个    ，49个原子，我也不确定。原子太多了？。CALYPSO能预测到其结构吗？  有什么技巧，需要版权？ 大神，能加个微信或QQ 吗  ？  留个联系方式呗
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6楼2023-04-23 21:34:11
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大力2010

金虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2023-04-21 08:04:24
比两个原子共价半径之和稍小10%

大神  这个提交了  ，不运行  ，啥原因    求指教 。 这是 INCAR.dat 部分内容：
Volume=20   
@DistanceOfIon
  1   1.5
  1.5  1.5
# 2   3
# 3   1.8   

@End  

Ialgo=2  
ICode=1  
NumberOfLocalOptim=3  
NumberOfLbest=4
PsoRatio=0.6
PopSize=30  
Kgrid=0.12 0.06  
Command=sh submit.sh
# Command= cloud-vasp.sh
MaxStep=50
PickUp=F
PickStep = 1
Parallel = F
NumberOfParallel=4
LMC= F
GenType=1


测试路径：/public1/home/scb3341/CALYPSO/CALYPSO_x86/new
测试脚本：calypso.sh
提交作业：sbatch  calypso.sh
查看作业情况：squeue
有在用 callypso的大神吗  ，d12 的值怎样确定 ？
QQ截图20230506170309.jpg
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7楼2023-05-06 17:12:05
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