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250260882木虫 (正式写手)
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【求助】优化的构型如何消去虚频
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我用gaussian03对一个稳定态构型进行优化时,正常结束,但是查看频率时 有三个虚频,-607.-94,-92,如何消去虚频?谢谢.这个构型还有必要要吗? [ Last edited by dongdong3881 on 2009-12-12 at 09:27 ] |
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250260882(金币+1,VIP+0):是把三个虚频的坐标同时除以2加到优化的坐标里，还是 分别加上单独算？？？？？？，谢谢 9-27 19:42
250260882(金币+1,VIP+0):谢谢，不过我有三个虚频，一块加上吗？ 9-27 19:53
fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 12-13 17:01
250260882(金币+1,VIP+0):是把三个虚频的坐标同时除以2加到优化的坐标里，还是 分别加上单独算？？？？？？，谢谢 9-27 19:42
250260882(金币+1,VIP+0):谢谢，不过我有三个虚频，一块加上吗？ 9-27 19:53
fegg7502(金币+2,VIP+0):thank you very much! 12-13 17:01
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在高斯的输出文件里，列出了虚频的振动模式（以XYZ三个方向的坐标列出的），你可以把这些坐标同时乘以一个0～1之间的系数（建议使用0.5)，再加到优化后的坐标里，再重新优化，一般都消掉。 例如： 1 A' Frequencies -- -707.3181 Red. masses -- 1.0573 Frc consts -- 0.3117 IR Inten -- 24.5978 Atom AN X Y Z 1 6 0.05 0.02 0.00 2 6 0.03 0.01 0.00 3 1 -0.21 0.40 0.00 4 1 -0.61 -0.53 0.00 5 1 -0.19 -0.32 0.00 对应的虚频 -707.3181的振动模式就是 X Y Z 0.05 0.02 0.00 0.03 0.01 0.00 -0.21 0.40 0.00 -0.61 -0.53 0.00 -0.19 -0.32 0.00 将这些坐标乘以一个0～1之间的系数，再加到Standard orientation的坐标里面去，再重新优化就可以了 Standard orientation: --------------------------------------------------------------------- Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z --------------------------------------------------------------------- 1 6 0 0.047915 0.719192 0.000000 2 6 0 0.047915 -0.586151 0.000000 3 1 0 -0.880556 -1.164400 0.000000 4 1 0 -0.663020 1.532329 0.000000 5 1 0 0.968595 -1.166173 0.000000 --------------------------------------------------------------------- [ Last edited by zeoliters on 2009-9-27 at 12:49 ] |
3楼2009-09-27 19:39:05
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