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金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于amber软件

各位xdjm，想学习amber软件，可是目前一无所知，不知道从哪头下手？看到介绍说amber能针对解决小分子与大分子对接的分子动力学问题。劳烦大家给我点指导，介绍相关书籍，文献给我，先谢谢了！
另外，想最好能找个朋友多交流。

1楼 2009-09-27 10:15:27

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铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gwdavid(金币+2,VIP+0):谢谢 9-29 15:58

amber主页有非常详细的tutorial。从简单到复杂，看完基本差不多了。

2楼2009-09-27 12:51:59

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金虫 (小有名气)

谢谢，赶紧去看看。

3楼2009-09-29 09:10:43

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金虫 (正式写手)

★ ★ ★
gwdavid(金币+3,VIP+0):谢谢 9-29 15:58

最好注册分子模拟论坛，上面的资源很多，然后有一些很有名的博客在这方面的介绍比较好，比较细。比如一个叫思想家的公社的人的博客。可以作为指导。这个关键得自己多跑例子才行。至于跑分子间的作用，各个MD程序都差不多。

分子模拟的主页http://varmilion.tk/

4楼2009-09-29 12:42:17

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