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请问lammps分子动力学模拟,出现lost atoms问题如何处理?
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请教一个问题,我用lammps模拟的时候,往一个盒子里插入了单条polymer链之后对体系进行平衡,模拟运行到一半会自动停止,报错:Lost atoms,用vmd查看输出的轨迹发现最后一帧polymer链消失了,另外轨迹文件里可以看到盒子很快缩成很小很小的尺寸(几乎没有了)。 请教一下可能是什么地方出现了问题?应该从哪些方面考虑修改模型? (平衡过程用的npt,周期性边界条件,polymer链内部的原子间用的fene力场) |
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