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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】linux 装gaussian问题不断
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mengfc

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】linux 装gaussian问题不断

我在安装linux gaussian的时候出现

Erroneous write during file extend. write 128 instead of 4096
Probably out of disk space.
Write error in NtrExt1
怎么办？
我在网上查的有的说是内存的问题，我的内存是8G，也有的说是硬盘不够，我在装Linux分区的时候SWAP分了10G，“/”分了80G，是不是这里有问题？还是别的地方出了问题？
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1楼2009-09-24 23:02:37
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-25 08:56
用的是红帽子吧，在root 权限下输入
echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_va_space
试试看

确认在运行高斯之前， /proc/sys/kernel/randomize_va_space 文件的值为0

[ Last edited by bay__gulf on 2009-9-25 at 08:55 ]
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2楼2009-09-25 08:14:25
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sandf

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是Dell的机子吗？ 我有一款dell的机子也是这个问题，据说是linux内核和硬件不支持。所以基本没辙了，我试了很多版本都是跟你一样的错误，就差没编译gaussian源代码和重装其他linux系统了。希望1楼的方法能有效。
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努力呀努力，不要成为奴隶。
3楼2009-09-25 08:44:39
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jyzhao1985

我也遇到过这个问题，2楼说的对
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4楼2009-09-25 09:45:35
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jove1782

木虫 (正式写手)

小木虫风雅协会代理秘书长
★
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-26 13:22
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2009-9-25 08:14:
用的是红帽子吧，在root 权限下输入
echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_va_space
试试看

确认在运行高斯之前， /proc/sys/kernel/randomize_va_space 文件的值为0

[ Last edited by bay__gulf on  ...

就是这样

原因是内核在编译时设置有问题，如果重新编译内核 或者gaussian，这个问题就不存在了
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もっとも永く続く?郅稀螭铯欷�?郅扦ⅳ搿�
5楼2009-09-25 09:54:34
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mengfc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2009-9-25 08:14:
用的是红帽子吧，在root 权限下输入
echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_va_space
试试看

确认在运行高斯之前， /proc/sys/kernel/randomize_va_space 文件的值为0

[ Last edited by bay__gulf on  ...

恩~已经可以运行了，但又出现了个问题。我的电脑是4核的CPU，为什么我设%nproc=4是计算所需要的cpu时间要比%nproc=1时的要长呢？
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6楼2009-09-25 12:54:51
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)
任务太小？
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7楼2009-09-25 13:22:15
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mengfc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by Jasminer at 2009-9-25 13:22:
任务太小？

任务还真的很小，对水分子opt freq，小就会出现这种情况吗？
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8楼2009-09-25 15:18:20
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+2,VIP+0):哈哈，形象！ 9-26 13:22
并行时候需要对任务进行分配，以及网络间需要通信，这些在单核计算时候不需要。
如果任务太小，并行效率发挥不来，
就像搬砖头，1人一次搬一块，
如果100块，并行就像是10个人搬，一共十次就行了，
而如果只有1,2块也要10个人搬，还没有商量好让谁搬，人家一个人的就已经办完了
赞一下(11人) 回复此楼
9楼2009-09-25 15:58:21
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mengfc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2009-9-25 15:58:
并行时候需要对任务进行分配，以及网络间需要通信，这些在单核计算时候不需要。
如果任务太小，并行效率发挥不来，
就像搬砖头，1人一次搬一块，
如果100块，并行就像是10个人搬，一共十次就行了，
而如果只有 ...

哦，这样啊，我还以为我的软件有问题呢！吓我一跳！谢谢你了！
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10楼2009-09-25 16:07:51
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