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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】用discover如何取坐标
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shaopeng6539

[交流] 【求助】用discover如何取坐标

请教大家两个问题：
1，我用discover模块跑动力学，在自己的机子上跑完动力学得出的轨迹文件可以restart，请问这个restart是什么意思，我理解成在restart前的是用于平衡的，再restart才可以收集数据，不知道这么理解对不对，可是提交到服务器上就无法显示restart，我直接先跑10万步用于平衡，再跑5万步用于收集数据，这么做是否和在自己机子上点restart是一样的呢，谢谢
2，我是在做加温的研究，比如我想每隔50k加温，如果想收集100k的数据，我是不是要在50k跑完的轨迹文件上继续跑呢，如果收集150k就在100k的轨迹文件上跑呢，直接用得出的轨迹文件跑对吗，还是要输入坐标呢，可是在materials studio这么取坐标呢，谢谢
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1楼 2009-09-22 10:38:18
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
shaopeng6539(金币+1,VIP+0): 9-23 08:21
wuchenwf(金币+3,VIP+0):谢谢 9-24 22:00
1动力学那里的restart？那个是可以接着算，先跑10万步用于平衡，再跑5万步用于收集数据这个可以一次性完成，不用restart
2不是轨迹文件，是结构。有结构就行了，这样可能相对于都从头开始会快点
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2楼2009-09-22 13:23:03
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shaopeng6539

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-9-22 13:23:
1动力学那里的restart？那个是可以接着算，先跑10万步用于平衡，再跑5万步用于收集数据这个可以一次性完成，不用restart
2不是轨迹文件，是结构。有结构就行了，这样可能相对于都从头开始会快点

谢谢版主，可是再问下结构文件怎么看呀，是什么形式，我是把轨迹文件跑的最后一步当做结构文件提交，不知道这么做对不对，就是想算100k就应该把50k的结构文件作为输入文件呗？不会找结构文件，请在指点，谢谢
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3楼2009-09-23 08:29:35
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
shaopeng6539(金币+1,VIP+0): 9-23 08:59
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 9-24 22:00
也可以，就是最后生成的xsd或car文件
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4楼2009-09-23 08:39:01
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shaopeng6539

不好意思，版主，给你添麻烦了，这是我跑出的8个文件，里面并没有你说的结构文件，虽然有.car的文件，但它是本次跑的输入结构，并没有输出结构，我想确认一下，谢谢
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5楼2009-09-23 09:15:14
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 9-24 22:00
把你的out文件的最后一部分发出来
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6楼2009-09-23 16:19:28
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shaopeng6539

谢谢指导
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7楼2009-09-23 18:31:54
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuchenwf(金币+1,VIP+0):谢谢 9-24 22:01
哦，我想起来了，你的inp文件最后缺一句
writeFile molecular_system filename = XX
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8楼2009-09-24 08:43:16
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