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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于PCR引物
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midie

金虫 (小有名气)

[交流] 关于PCR引物

一个考研的学妹问我这个问题，我实在是不懂啊，有哪位高手能告诉我原理？
大肠杆菌某一多肽基因的编码链的序列是：
5′ACAATGTATGGTAGTTCATTATCCCGGGCGCAAATAACAAACCCGGGTTTC3′
如果使用PCR扩增该基因，需要合成两段(dNMP)6作为引物，请写出(dNMP)6核苷酸序列。
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1楼 2009-09-20 20:18:17
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看看如何合成引物吧？ 一般是在两端的几个碱基，不过要加保护碱基~
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Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
2楼2009-09-20 21:08:14
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annwt

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ACAATG
gaaacc
经常用软件，很长时间不手写了！
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3楼2009-09-20 21:11:43
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by annwt at 2009-9-20 21:11:
ACAATG
gaaacc
经常用软件，很长时间不手写了！

为什么你5`端 不是配对序列而是原序列?
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4楼2009-09-20 22:10:06
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lywinan

捐助贵宾 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引物一般上引物与模板链相同，下引物与模板链互补，DNA是双链啊
引用回帖:
Originally posted by yixuanwin at 2009-9-20 22:10:



为什么你5`端 不是配对序列而是原序列?

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5楼2009-09-20 22:23:18
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yixuanwin at 2009-9-20 22:10:



为什么你5`端 不是配对序列而是原序列?

用配对序列的话是拉不出来的！
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6楼2009-09-20 22:27:35
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midie

金虫 (小有名气)
哇，谢谢各位了，我明白了
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7楼2009-09-21 08:07:51
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zhuifeng7000 at 2009-9-20 22:27:


用配对序列的话是拉不出来的！

我新手不太懂。。。你一边用原序列  一边用的是配对序列。。。能解释下原理么？谢谢
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8楼2009-09-21 14:44:12
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zhouzhou_3006

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
DNA两条链，其实每条链的引物都是与他们互补的，要不怎么合成出两条链？
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为梦想努力。
9楼2009-09-21 14:52:01
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yixuanwin at 2009-9-21 14:44:



我新手不太懂。。。你一边用原序列  一边用的是配对序列。。。能解释下原理么？谢谢

还是以楼主的片段作为例子吧！
5′ACAATGTATGGTAGTTCATTATCCCGGGCGCAAATAACAAACCCGGGTTTC3′
5‘端若以其互补链作为引物6个碱基则为：3’TGTTAC5‘，这条引物在退火的时候与该链结合，成为：
......3’TGTTAC5‘
......5'ACAATGTATGGTAGTTCATTATCCCGGGCGCAAATAACAAACCCGGGTTTC3′......
因DNA聚合酶方向是5’-3‘，这样你就能看出拉出的是什么了吧？
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10楼2009-09-21 23:11:10
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