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shaopeng6539

[交流] 【求助】跑动力学无法平衡问题求助

我是用discover模块做动力学研究,我先setup再minimize,将minimize好的结果开始跑动力学,可是温度和能量一直不平衡,我就无法收集数据,请看附件,最初和最后能量偏差很大,参照文献跑的时间应该足够了,请问在能量和温度平衡这一步应该注意些什么,谢谢
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guosy1999

木虫 (正式写手)

中纪委反2协会督导员


shaopeng6539(金币+1,VIP+0): 9-21 08:07
要看是什么系综,以及步长等,当然最重要的还是体系初始结构的稳定性。。

我用discover做一点扩散的东西,可以交流一下。。呵呵
少年不识愁滋味,为赋新词强说愁。
2楼2009-09-20 19:30:16
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qasd

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
多少步的minimize?多少步动力学?
3楼2009-09-21 08:26:49
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shaopeng6539

10000步minimize,动力学10万步用于平衡5万步用于收集数据,参照文献动力学时间足够,谢谢指点
4楼2009-09-21 11:03:46
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qasd

木虫 (著名写手)

能量还好啊,温度呢?
5楼2009-09-21 11:57:21
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shaopeng6539

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2009-9-21 11:57:
能量还好啊,温度呢?

minimize不是只能显示这一个图吗,跑动力学才有两个图,关于能量和温度随模拟时间的图呀,在自己机子上跑才能出现这两副图,可是我提交到服务器上下载后就没有图了,所以我不知道温度和能量是否平衡呀,但是跑的步数绝对够了。这是我在服务器上下载下的文件,只有这8个,没有图形呀
6楼2009-09-21 14:41:57
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