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agric

新虫 (初入文坛)

[求助] BSA混池 已有1人参与

想请问一下做过BSA混池的，如果混池测序结果出来后是跟亲本序列对比还是跟已有的基因组对比比较好了？单独做混池计算SNP-index还是混池结合660K芯片比较好呢？麻烦大家了，谢谢！

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1楼 2023-02-18 00:52:34
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AD_com

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一般是跟参考基因组比较，因为要把测序数据mapping上去，二代测序太短了，是需要参考基因组的
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2楼2023-02-18 19:26:01
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agric

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by AD_com at 2023-02-18 19:26:01
一般是跟参考基因组比较，因为要把测序数据mapping上去，二代测序太短了，是需要参考基因组的

知道了，谢谢！

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3楼2023-02-19 13:33:15
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