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SeldiTofMs

新虫 (初入文坛)

[交流] 北京伯奥克生物技术有限公司SELDI技术服务

北京伯奥克生物技术有限公司拥有较为成熟的SELDI-TOF-MS技术,用于快速而有效地对蛋白样品进行分离、处理、数据分析和鉴定,建立蛋白质组数据库,发现疾病的相关蛋白和具有重要应用前景的生物标记分子,建立疾病的早期诊断和治疗监测方法,为广大科研工作者提供先进的技术服务——蛋白质样品SELDI-质谱-数据处理分析。

一、项目目标
针对血清、血浆、体液、组织、真菌、细菌、细胞培养物以及植物等样本的差异蛋白质组研究,以蛋白质芯片为载体,通过对目标疾病样本组及对照组之间进行鉴定,以期找到能够区分不同组别的差异峰,并通过对差异峰进行蛋白质鉴定,期望找到与目标疾病密切关联的基因/蛋白。

二、项目实施方案
2.1.样品准备
以血清为例,采集临床病人及正常人血清,并做好临床资料的收集。采样数量大于100 例,一般情况下病人样品与正常人样本相等,也可以病人样品略多于正常人。
2.2.实验及进度
芯片采用BIORAD公司的蛋白质芯片或长春博坤公司的液态芯片磁珠。分为三个阶段:
2.2.1.先进行预实验阶段:对相关的实验条件进行摸索,确定最佳的实验参数,约花时2周。
2.2.2.正式实验阶段:对样品进行实验操作,得到质谱图,约1-2 周。
2.2.3.数据分析阶段:对实验得出的原始质谱数据进行分析,分析项目包括原始数据的分布情况分析、差异峰的筛选、基本统计分析(SPSS)、聚类分析(BPS)、主成分分析(PCA)、疾病预测模型的构建差异峰所对应的蛋白的生物信息学鉴定等项目,以充分挖掘原始数据中有价值的信息。约1 周。
2.3.蛋白质鉴定
    对差异峰所对应的蛋白进行蛋白鉴定。采用的实验方法为利用蛋白表达实验中所对应的类型磁珠对阳性和阴性两例样品进行纯化(如蛋白表达时用WCX2/CM10芯片,纯化则用WCX磁珠),使总蛋白含量达到120ug/mL,蛋白浓缩后电泳实验找到相对应的蛋白胶点,胰酶消化后进行MS/MS测序工作,必要时用免疫沉淀方法进行抗体验证。如发现目标蛋白,这将是一篇很好的SCI论文。时间约为1-2 个月。

三、合作方式:
3.1.课题招标:本中心将指定相关研究领域并提供部分研究条件与经费。
3.2.自荐课题:合作者提出课题,专家推荐,立项后可获得部分研究条件。
3.3.自费课题:自立项目,自筹经费,本中心提供部分研究条件。
3.4.合作课题:双方协商确定研究内容,自备部分经费。
3.5.学位课题:自带课题与经费,帮助研究生完成毕业答辩。

联系方式
北京伯奥克生物技术有限公司
地址:北京海淀区北三环西路48号北京科技会展中心3号楼20A(100086)
联系人:陈国良(13391570775)  李宁(13801362042)
电话:010-60741010             传真:010-60741011
Email: glchen@biock.cn         nli@biock.cn
网址:www.biock.cn
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