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增强子与启动子相互作用绕过CTCF介导边界
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增强子与启动子相互作用绕过CTCF介导边界 美国国立卫生研究院的Pedro P. Rocha课题组发现，增强子与启动子的相互作用可以绕过CTCF介导的边界，并有助于表型的稳健性。相关论文1月30日在线发表于《自然-遗传学》。 研究人员表示，增强子如何激活其远端靶标启动子仍不完全清楚。 研究人员剖析了CTCF介导的环化如何促进和限制这种调控相互作用。通过利用小鼠突变体的一个等位基因系列，研究人员表明CTCF既不是Sox2基因与远端增强子相互作用所需的，也不是其表达所需的。在Sox2及其远端增强子之间插入CTCF基序的各种组合产生了具有不同绝缘程度的边界，这与转录输出的减少直接相关。然而，在外胚层和神经组织中，增强子接触和转录诱导都不能完全消除，并且插入也不能破坏着床和神经发生。 相比之下，在携带最强边界的突变体前部前肠中检测不到Sox2的表达，这些动物在该组织中完全表型地丢失了Sox2。研究人员认为具有高密度调控活性的增强子簇可以更好地克服物理障碍，以保持忠实的基因表达和表型一致性。 相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41588-022-01295-6 |
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