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A小科研

新虫 (小有名气)

[交流] 分子对接 虚拟筛选 分子动力学 薛定谔等

药物四个专题
(CADD+AMBER+薛定谔+AIDD)

专题一:CADD蛋白结构分析、虚拟筛选、分子对接(蛋白-蛋白、蛋白-多肽)
生物分子互作基础、蛋白数据库、蛋白结构分析、同源建模
、小分子构建、小分子化合物库、生物分子相互作用、虚拟筛选
、小分子格式转换、拓展对接使用场景、基于碎片药物设计、构效关系分析
、分子动力学模拟

专题课程二:AMBER 分子动力学能量优化与分析、结合自由能计算专题
分子动力学入门理/论 研究对象模型获取 、研究对象模型构建 、
分子动力学模拟 、结合自由能计算、可视化软件等......

专题课程三:薛定谔分子对接、药效团虚拟筛选、3D-QSAR 化合物活性分析专题
蛋白-配体相互作用、柔性对接及基于结构的虚拟筛选 、基于药效团虚拟筛选、构效关系模型预测分
子活性

专题课程四:AIDD 人工智能(机器学习与深度学习)辅助药物发现专题
基于深度学习的药物发现
使用 DNN,GCN,GAT 等主流深度学习
模型进行实操 等内容......

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