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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 催化 » 理论交流 » 【Guassian计算求助】怎么算 四水合硝酸锰 和六水合硝酸镍 的分子动力学直径
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lk2019

新虫 (小有名气)

[求助] 【Guassian计算求助】怎么算 四水合硝酸锰 和六水合硝酸镍 的分子动力学直径

【Guassian计算求助】
请问大家有人知道怎么算 四水合硝酸锰 和六水合硝酸镍 这种东西的分子直径吗？
因为做实验用到这两种药品，它们的熔点都很低，加热就变成液态。
但是现在的困难是不知道熔盐状态下，这两个物质的分子动力学直径，也就不能判断能不能通过过滤孔。
我想根据计算化学论坛上 大佬sobereva发的计算分子动力学直径的方法用高斯 wft 和VMD联合去算一下。
但是遇到的问题是，这两个物质都不是有机物，是盐的水合物。四水合硝酸锰能从剑桥CCDC数据库找.mol2结构文件
但是六水合硝酸镍的找不到，只能找到cif晶胞文件自己删掉多余的然后用diamond转成mol文件用Guassian view识别。

我想向各位大佬求助 我上述的方法对吗。还有关于金属盐水合物这种东西 用什么去算结构优化呢 B3LYP/def2tzvp可以吗
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1楼 2023-01-15 22:49:12
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