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可可的奶茶

新虫 (小有名气)

[交流] lammps运行full类型报错 已有3人参与

请问一下lammps识别不出full,Unrecognized atom style 'full' is part of the MOLECULE package which is not enabled in this LAMMPS binary. (../atom.cpp:511)

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with you

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
原子类型有问题吧

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2楼2022-12-03 16:32:21
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可可的奶茶

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by with you at 2022-12-03 16:32:21
原子类型有问题吧

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3楼2022-12-03 16:42:07
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可可的奶茶

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by with you at 2022-12-03 16:32:21
原子类型有问题吧

#初始模拟系统设置
units           real
atom_style      full
boundary        p p p
#构建模型
region box block 0 20 0 20 0 20 units box  
create_box 2 box bond/types 1 &
angle/types 1 &
extra/bond/per/atom 2 &
extra/angle/per/atom 1 &
extra/special/per/atom 2
molecule m1 h2o.dat2
create_atoms 0 random 10 666 box mol m1 666 units box
mass 1 16.01
mass 2 1.01
set type 1 charge -1.1128
set type 2 charge 0.5564
write_date dat.lmp
#定义相互作用势
pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.1546 9.0 9.0
pair_style pppm/tip4p/ 1.0e-15
pair_coeff * * 0.0 0.0
pair_coeff 1 1 0.1852 3.1589
bond_style harmonic
angle_style harmonic
bond_coeff 1 0.0 0.9 572
angle_coeff 1 0.0 104.52
#输出
dump 1 all custom 1000 wat.dat id type x y z
#环境
velocity all create 300 123
fix 1 all shake 1.0e-4 200 0 b 1 a 1
fix 2 all nvt temp 300 300 100
timestep 1
run  0

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4楼2022-12-03 16:44:10
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可可的奶茶

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by with you at 2022-12-03 16:32:21
原子类型有问题吧

应该不是,感觉是缺什么包,或者文件

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5楼2022-12-03 16:45:20
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
重新装一下lammps, 装一下 MOLECULE 的包
6楼2022-12-03 20:09:23
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彩虹猪头吧

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 可可的奶茶 at 2022-12-03 16:45:20
应该不是,感觉是缺什么包,或者文件
...

没安装molecule的包,下载这个包,重新编译一下就好了。
7楼2023-02-06 21:25:16
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