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freshgirl

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】VNL创建分子界面是否不能自动补氢

建立了一个分子cluster,但是边界原子键不饱和,所以想通过补氢的方法。但是发现右键点击选择边界原子后,adjust geometry不能自动补氢。反而是出现replace[carbon]的选项。

请问各位一般是怎样补氢的?
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛


freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢,是这个原因 10-13 10:50
楼上说的对,一般这种情况的原因是杂化的原因,把相应原子的sp3杂化改成sp2杂话即可自动添加原子(或者其他杂化)

[ Last edited by zdhlover on 2009-10-12 at 02:12 ]
4楼2009-10-12 22:10:36
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iamddba

铁杆木虫 (正式写手)


freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢讨论。你说的方法对,但是我有20多个原子要补氢,用这种方法,一定眼睛花掉 9-16 21:57
用键盘 "insert" 添加氢然后再连上键也不行吗?
2楼2009-09-16 11:10:27
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落花飞雪

木虫 (小有名气)

人海孤鸿


freshgirl(金币+1,VIP+0):谢谢,是这个原因 10-13 10:50
是不是Hybridization的选择有问题呢?
下雪了,如果我们不撑伞,一直走下去,是不是可以一路到白头?
3楼2009-10-12 21:37:13
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