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里来医学

铜虫 (小有名气)


[交流] 条带依旧问题百出?IP/CoIP细节TIPS,为您整理! 已有1人参与

细胞功能,最后的执行者大多数都是蛋白质。蛋白质可谓是细胞的调控者,控制着细胞中的所有工作,但是想要细胞高效运作,往往需要多个蛋白参与,蛋白质之间的相互作用,贯穿整个生命周期,参与完整的生命过程。

想要研究清楚细胞的运作机制,蛋白之间的互作就是最基础的研究项目,而 IP/CoIP 则是研究这基础上的常用方法,关于 CoIP 的实验原理和方法前文已科普。
然而IP/CoIP 虽然常用,但并不简单,可以称得上是门技术活,跟着步骤一步步做,都可能会做不出好看的条带图,那其中有哪些需要注意的地方呢

简述实验步骤
Co-IP实验基本步骤
·温和条件下破碎细胞
·加入目标蛋白抗体,孵育结合
·加入亲和介质进行洗脱
·对洗脱蛋白质进行检测分析

实验中常见的细节TIPS
稍不注意,目的蛋白丢失
1. 非特异的蛋白结合:在免疫沉淀前用 ProteinA/G 珠子预洗,免疫沉淀后增加漂洗次数和严谨度(高盐或者去垢剂);
2. 裂解液严谨度太低:改用高严谨度裂解液;
3. 实验仪器或者液体被污染:使用洁净的仪器或者液体;
4. 转移膜上存在非特异性吸附:戴手套、用镊子,不触碰膜转移面。

选择两个不同种源的抗体
在实验中,IP的抗体用量较大,会导致抗体重链55kd的信号会很强。如果用单一种源的抗体作为二抗进行显色,那么抗体重链55kd处的IP抗体的重链会干扰我们对目的蛋白的分辨如果选择两种种源的抗体,则不会有这个问题。

磁珠or琼脂糖?
任选,种类不重要,关键是品质!

磁珠或者琼脂糖的作用在于ProteinA/G可以特异性结合免疫球蛋白的FC片段,从而结合抗体,而抗体又可以和目的蛋白结合,优质的磁珠或者琼脂糖珠子对我们实验的成功帮助很大。

CoIP 为何经常遇到假阳性?
假阳性主要和抗体的浓度还有特异性有关,所以当抗体浓度高了,就降低浓度;抗体特异性差,就更换抗体。

如何去除重链和轻链的影响
阴性对照记得加,可以采用的方法很多,比如用兔的lgG做对照,或者用抗 Fab和Fc的抗体特异性封闭轻链和重链。

蛋白互作信号弱,低到总是测不到
1. 裂解液过于强烈:采用温和的裂解条件,避免破坏细胞内存在的蛋白间相互作用,裂解、洗涤时需使用非变性裂解液,如 NP-40 和 Triton X-100;
2. 受蛋白亚细胞定位的影响:应该重新选择其他裂解液来释放出蛋白;
3. 蛋白间相互作用弱:增加目的蛋白的量,以捕获更多的相互作用蛋白,从而得到更容易观察的结果。具体办法有选择亲和力更强的抗体捕获更多目的蛋白。或者过表达提高目的蛋白的含量。
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timmyVVV

铁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好,请问一变性裂解液提取蛋白可以检测到信号,但是用非变性裂解液(NP40, RIPA弱,WB&IP裂解液我都试过)提取蛋白检测不到信号是为什么呢?

发自小木虫Android客户端
2楼2023-09-30 23:50:36
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