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包包波比

铁虫 (初入文坛)

[求助] 为什么MS构建石墨烯的步骤不同会导致POSCAR文件里原子位置不同,而VESTA显示构型相同

在MS使用石墨构建单层石墨烯,在删除一层原子后
先cleave surface(添加15埃真空层),再supercell4x4x1,得到的POSCAR:

Graphene
1.0
        9.8400001526         0.0000000000         0.0000000000
       -4.9200000763         8.5216901054         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000        15.0000000000
    C
   32
Cartesian
     0.000000000         0.000000000         0.000000000
     1.229999836         0.710002325         0.000000000
     2.459999745         0.000000000         0.000000000
     3.689999581         0.710002325         0.000000000
     4.919999490         0.000000000         0.000000000
     6.149999326         0.710002325         0.000000000
     7.379998941         0.000000000         0.000000000
     8.609998191         0.710002325         0.000000000
     8.610000060         2.130007165         0.000000000
     0.000000000         2.841009418         0.000000000
     1.229999799         2.130007165         0.000000000
     2.459999598         2.841009418         0.000000000
     3.689999397         2.130007165         0.000000000
     4.919999636         2.841009418         0.000000000
     6.149999436         2.130007165         0.000000000
     7.379999088         2.841009418         0.000000000
    -2.459999693         4.261014194         0.000000000
    -1.229999872         4.971016709         0.000000000
     0.000000000         4.261014194         0.000000000
     1.229999726         4.971016709         0.000000000
     2.459999745         4.261014194         0.000000000
     3.689999471         4.971016709         0.000000000
     4.919999197         4.261014194         0.000000000
     6.149998922         4.971016709         0.000000000
     6.150000682         6.391020724         0.000000000
    -2.459999745         7.101023239         0.000000000
    -1.229999726         6.391020724         0.000000000
     0.000000000         7.101023239         0.000000000
     1.230000019         6.391020724         0.000000000
     2.459999745         7.101023239         0.000000000
     3.689999471         6.391020724         0.000000000
     4.919999197         7.101023239         0.000000000
先surpercell4x4x1,再cleave surface(添加15埃真空层),得到的POSCAR:
Graphene
1.0
        9.8400001526         0.0000000000         0.0000000000
       -4.9200000763         8.5216901054         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000        15.0000000000
    C
   32
Cartesian
     0.000000000         0.000000000         0.000000000
     1.229999836         0.710002325         0.000000000
     8.610000060         2.130007165         0.000000000
     0.000000000         2.841009418         0.000000000
    -2.459999693         4.261014194         0.000000000
    -1.229999872         4.971016709         0.000000000
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    -2.459999745         7.101023239         0.000000000
     2.459999745         0.000000000         0.000000000
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     0.000000000         7.101023239         0.000000000
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     4.919999197         7.101023239         0.000000000
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包包波比

铁虫 (初入文坛)

但是两个文件拖进VESTA里面显示的构型又一模一样(小白,不会在小木虫的发图片
2楼2022-10-21 19:30:28
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