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万事顺意北新虫 (正式写手)
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想问一下如何用gaussian计算溶质的总静电能，可以用gaussian计算吗 发自小木虫IOS客户端 |
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paramecium86
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+10 2022-08-25 13:37:47
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zhou2009: 金币+10 2022-08-25 13:37:47
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溶解自由能分解成不同的组成部分可以用Dovacuum关键词。比如写成下面的关键词 #p m052x/6-31g(d) SCRF=(smd,externaliteration,dovacuum) 这种写法算出来的溶解自由能就是跟自己算两次单点能（气相和溶剂中）相减得到的溶解自由能数值是一样的。 输出文件重会有类似下面的部分 Self-consistent PCM results =========================== <psi(0)| H |psi(0)> (a.u.) = -569.434121 <psi(0)|H+V(0)/2|psi(0)> (a.u.) = -569.533542 <psi(0)|H+V(f)/2|psi(0)> (a.u.) = -569.539399 <psi(f)| H |psi(f)> (a.u.) = -569.431013 <psi(f)|H+V(f)/2|psi(f)> (a.u.) = -569.536292 Total free energy in solution: - with all non electrostatic terms (a.u.) = -569.526641 -------------------------------------------------------------------- (Unpolarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -62.39 (Polarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -66.06 Solute polarization (kcal/mol) = 1.95 Total electrostatic (kcal/mol) = -64.11 -------------------------------------------------------------------- SMD-CDS (non-electrostatic) energy (kcal/mol) = 6.06 Total non electrostatic (kcal/mol) = 6.06 DeltaG (solv) (kcal/mol) = -58.06 其中 Total electrostatic 就是溶解自由能中总的静电部分的贡献。 |
2楼2022-08-25 12:44:16
万事顺意北
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3楼2022-08-26 08:33:58