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pqw1234

新虫 (初入文坛)

[交流] 三个ATG,怎么确定从哪个ATG开始翻译起始呢

芽孢杆菌几丁质酶基因,测序确定的序列有三个ATG,相距不远,都查三的倍数个碱基。不能确定到底从哪个ATG开始翻译,BLAST了一下,同源的60多个几丁质酶基因,有的预测从第一个,有的从第二个,还有的从第三个,非常混乱,没有一个绝对的标准。请问大家到底有什么办法能够确定从哪个ATG开始翻译的么。谢谢。
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wrb456

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
找一下核糖体结合位点(RBS),看后面第一个ATG在哪,即是翻译起始位点!
2楼2009-09-11 22:09:32
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gastrodia

金虫 (正式写手)

三种TAG开始都进行翻译,遇到终止子即终止翻译,然后把三种翻译结果分别去BLast,即可根据蛋白质的比对结果判断起始
3楼2009-09-11 22:27:28
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

肯定是第一个。
生物资源交流QQ群:1044518333
4楼2009-09-11 22:44:43
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

找ORF,先找到RBS
5楼2009-09-12 08:57:00
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