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求助：关于荧光标记引物的问题
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我想作转座子显示，它是一种基于AFLP的技术。里边要用到荧光标记或放射性标记的引物。我看的几篇文献和我做的物种、类型类似，所以打算采用上边的引物、接头和实验方法。但是里边选择性扩增中一条引物采用了IRD-700标记，最后在LiCor-4300测序仪上进行分析。因为我询问了下外边的公司，没有用过IRD-700标记，他们的测序仪是ABI 377，他们不清楚IRD-700标记的在这个测序仪上是否可用。而且IRD-700标记国内做不了，得拿到国外，2 OD/1000元，而普通的标记则便宜很多，例如FAM标记上海生工就可以，2OD/300元。所以我想问下，在这个实验里是否可以将IRD-700替换为其它荧光标记，例如FAM标记？如果无法替换，在ABI377上是否可以分析IRD-700标记的产物？ 还有哦，是不是可以不叫荧光标记，然后就跑普通的PAGE胶？它们的区别是不是就是灵敏性的差别，就如同普通PCR和real time PCR？ 加了荧光标记的引物，PCR产物是不是也可以跑普通的PAGE或者琼脂糖胶（就是自己先检验下PCR好坏，然后再拿到公司的测序仪上跑）？ 敬请各位指教。 [ Last edited by efdc on 2009-9-11 at 12:49 ] |
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