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陈思容

铜虫 (正式写手)

[交流] 求助有关基因测序问题

我刚上研二,关于课题的事实在没多少主意,望哪位高手指点一下!
  我的课题是研究一株烟曲霉合成胶霉毒素的基因,现在可以从NCBI上可下载到与其他种属比对得出的预测序列,请问要怎么样测序的!师姐建议我把这12个序列用cLUSTALX比对后,设计引物,PCR,然后测序,总感觉行不通呢!哪位有好主意啊,非常感谢!
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生命核心

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
同意anik的意见,测序很多不稳定因素
3楼2009-09-11 15:44:06
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anik

银虫 (正式写手)


生命核心(金币+1,VIP+0):感谢交流! 9-11 15:43
你师姐是对的,通过蛋白质序列比对会发现有保守区域,即通过此保守区域设计兼并引物,得到中间片断后可以做RACE,即可知道了全长,。。。
2楼2009-09-11 10:35:41
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陈思容

铜虫 (正式写手)

谢谢

问题是我的序列是经过和其他种属的曲霉比对后预测的序列,蛋白产物也是预测的,测序的话有人告诉我要连到T载体上,不能直接测得吗?还有一个问题,有个基因的序列去掉内含子尚有6400bp,恐怕插补进去,容量不够吧!
4楼2009-09-18 13:17:14
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xuezhen

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
学习一下,请问RACE是什么呀?刚入门,太多不懂。
5楼2009-09-18 16:35:42
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