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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 通过Forcite模块模拟硅铝酸盐地聚物是Al-O键长偏短的问题
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Sirius507

新虫 (初入文坛)

[求助] 通过Forcite模块模拟硅铝酸盐地聚物是Al-O键长偏短的问题 已有1人参与

请问各位老师同学，我参照其他文献模拟硅铝四面体的建模时，一直遇到Al-O键长过短导致RDF中少了一个峰，想请教一下具体是什么原因导致的。模拟采用Forcite模块中Compass力场进行结构优化和退火模拟，选用的NPT系综，但是计算出来的Al-O键长为1.65埃左右，请问是操作上还是设置上的问题，谢谢了

通过Forcite模块模拟硅铝酸盐地聚物是Al-O键长偏短的问题


通过Forcite模块模拟硅铝酸盐地聚物是Al-O键长偏短的问题-1


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1楼 2022-06-07 10:57:38
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天天进步啊

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1、Al-O键为1.65埃，太短？我觉得不短吧
2、RDF哪里少了峰？ 是Al-O的RDF，还是O-O的RDF？是在3埃，还是4埃？
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Sirius507
分子筛、分子动力学模拟，有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777
2楼2022-06-08 19:38:17
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Sirius507

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-06-08 19:38:17
1、Al-O键为1.65埃，太短？我觉得不短吧
2、RDF哪里少了峰？ 是Al-O的RDF，还是O-O的RDF？是在3埃，还是4埃？

不好意思才看到消息，非常感谢您的回答。
第一个问题，我是根据其他做地聚物的模拟文献中看到的，他们做出来的Al-O键长基本上是在1.75埃到1.8埃左右的，所以感觉自己模拟出来的键长偏短。
第二个问题，我理解的是Al-O键长偏短了所以导致RDF中缺少了Al-O位置处的峰，应该在1.75埃左右还有一个峰。
下图是参考的文献中模拟出来的总RDF峰。
通过Forcite模块模拟硅铝酸盐地聚物是Al-O键长偏短的问题-2



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3楼2022-06-09 10:10:59
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天天进步啊

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by Sirius507 at 2022-06-09 10:10:59
不好意思才看到消息，非常感谢您的回答。
第一个问题，我是根据其他做地聚物的模拟文献中看到的，他们做出来的Al-O键长基本上是在1.75埃到1.8埃左右的，所以感觉自己模拟出来的键长偏短。
第二个问题，我理解的是A ...

1、我是做分子筛的，也是研究硅铝酸盐，其中Al-O键1.8 埃算比较长的，你这个我就不知道了算长还是短了。如果你还不放心，可以多优化几次

2、文献中的RDF很奇怪，一般H-O、Si-O、Al-O、O-O的RDF各是一条曲线，所以图上应该有4条曲线，但是你这里的RDF是一条曲线上4个峰，这就让人摸不着头脑了。建议你找顶刊上的文章来重复。
3、你找的文献图是黑白的，看上去很像爱思唯尔期刊上的文章，爱思唯尔偏工科，档次不如 nature, AAAS, ACS, RSC, Wiley
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分子筛、分子动力学模拟，有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777
4楼2022-06-09 10:43:09
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Sirius507

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-06-09 10:43:09
1、我是做分子筛的，也是研究硅铝酸盐，其中Al-O键1.8 埃算比较长的，你这个我就不知道了算长还是短了。如果你还不放心，可以多优化几次

2、文献中的RDF很奇怪，一般H-O、Si-O、Al-O、O-O的RDF各是一条曲线，所 ...

好的非常感谢您，因为我是土木类的所以看的爱思唯尔期刊更多一些我再看看其他文献试一试吧，谢谢了

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5楼2022-06-09 11:33:12
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