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Quanma@ZJU新虫 (初入文坛)
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[交流]
关于转录起始位点TSS的定义
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网上查到的大部分定义为：转录起始位点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基，通常为一个嘌呤（A或G） 也有说是：转录起始位点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA模板链上的碱基 这里就出现了一个歧义，DNA有两条链，一条模板链（反义链，与RNA互补配对），一条编码链（正义链，与RNA序列相同），那么转录起始位点指的是哪条链上与新生RNA对应的碱基？ 根据我平时读的文献，新生RNA的5' end通常是一个G或者一个A，那么就意味着模板链对应的那个碱基是一个C或一个T，那么事实上，转录起始位点说的是DNA编码链上对应的那个碱基，而不是模板链上对应的碱基 也就是说第一种说法未明确的DNA链事实上是编码链，而第二种说法是错误的 有的文献会把启动子TATA box和TSS画在一起，据我所知TSS应该是在模板链上？那么这时候TSS又在模板链上了（我个人认为这种画法有问题） 不知道大家怎么看待这个问题？ |
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