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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何设计3‘和5’RACE的引物？
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huij007

铜虫 (小有名气)

[交流] 如何设计3‘和5’RACE的引物？

最近老板让做race，无奈啥也不懂，也不知道末端引物应该怎么设计？是不是通用引物呀？请高手虫子指点！
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1楼2009-09-08 20:56:20
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小白3521

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我们用的是takara的试剂盒，也还可以
就是根据你的已知序列分别设计两条特异引物，3‘是设计两条上游引物，5’设计的两条下游引物，一般来说，GC的比要比较高，碱基数也有要求范围，每个试剂盒的说明书应该有会写明适合该试剂盒的引物设计，lz好好看说明吧
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6楼2009-11-11 08:57:51
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jack6335

铁杆木虫 (正式写手)
★
huij007(金币+1):谢谢参与
我们都用试剂盒。
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砖石王老三！！！
2楼2009-09-08 21:05:21
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sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader
★
huij007(金币+1):谢谢参与
试剂盒能够快一点，当然你也可以自己按试剂盒配比分别单买试剂。现在smart race 比较流行，你可以试一试，而且价格也不是那么贵；忘了说了，不用你设计引物，但是如果你要是有你全长序列中的一段序列已知的话就更好了，操作会容易一些。

[ Last edited by sutao1979 on 2009-9-8 at 21:11 ]
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会当凌绝顶，一览众山小
3楼2009-09-08 21:10:07
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gastrodia

金虫 (正式写手)
和正常的引物设计一样，关键是Tm要高，提高扩增的特异性,如果你什么基础都没有的话，建议把invitrogen和Clontech的RACE kit说明书看一下
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4楼2009-09-09 10:08:11
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