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sophia_999

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】NBO 5.0计算键级

宏剑的一个ppt 上说用NBO 5.0可以分析键级和共振结构。
可是用Gaussian计算的时候输入文件除了需要pop=nboread的关键词外,在分子坐标后的一行还需要给出什么,才能在最后得到的nbo文件中给出Natural Bond Order和Resonance信息?

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 19:07 ]
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北京一叶567

木虫 (小有名气)

★ ★
sophia_999(金币+1,VIP+0):谢谢回复 9-9 08:47
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-9 08:58
$nbo bndidx $end
2楼2009-09-08 15:42:46
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sophia_999

金虫 (小有名气)

谢谢回复。
这样算出来的out文件里只有Wiberg bond index的结果,没有我想要的natural bond order和resonance。要进一步些什么呢?

[ Last edited by sophia_999 on 2009-9-9 at 08:46 ]
3楼2009-09-09 08:43:03
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


sophia_999(金币+1,VIP+0):谢谢参与.你说的对,具体的我正在学习中 9-9 17:37
现在的G03好象只含NBO3.0,5.0是一个单一的版本,应该用G03生成的*.47文件再来计算。这是菜鸟的猜测,不知是否如此。
4楼2009-09-09 13:54:28
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psfan

铁虫 (正式写手)


sophia_999(金币+1,VIP+0):谢谢回复.能否提供个网址,我怎么没找到呢? 9-9 17:38
最好用版主放出的g03b05的源码整合nbo50,然后用新编译的g03进行nbo分析
5楼2009-09-09 16:41:19
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


sophia_999(金币+1,VIP+0):谢谢, 你的回复对我很有帮助 9-10 13:04
好象NBO5.0手册说,用*.47文件修改其中的$nbo *** $end 为$nbo NRT $end ,然后用NBO5.0计算,就能得到共振结构和键级。不过其图形化显示好象要用NBOVIEW1.0来看。现在这东西在网上还未见踪迹。
6楼2009-09-09 21:08:15
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sophia_999

金虫 (小有名气)

我现在遇到的问题是, 用NBO 5.0进行NRT计算时, 没有正常结束, 给出的提示是too many atomic centers found, 有人知道这是为什么,怎样解决吗?
7楼2009-09-10 13:43:31
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


sophia_999(金币+1,VIP+0):谢谢你的解答. 9-12 17:25
引用回帖:
Originally posted by sophia_999 at 2009-9-10 13:43:
我现在遇到的问题是, 用NBO 5.0进行NRT计算时, 没有正常结束, 给出的提示是too many atomic centers found, 有人知道这是为什么,怎样解决吗?

NRT应该是计算不同共振结构的存在比例,好象应该指定孤对电子和化学键。如下图所示。
8楼2009-09-10 14:17:05
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